RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520057.1

IGHV3-62-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-62 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHV3-62, Length 340 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-62-201ENST00000520057 GMNNO75496 209 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 KRT33AO76009 404 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 PRDX6P30041 224 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 IFNA8P32881 189 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 SLC7A2P52569 658 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 SLC16A1P53985 500 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 H3F3AP84243 136 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 LIPEQ05469 1076 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 ITGADQ13349 1161 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 NRF1Q16656 503 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 SFRP5Q5T4F7 317 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 FAM69AQ5T7M9 428 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZNF613Q6PF04 617 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 Q6ZT83 130 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 CDC20BQ86Y33 519 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 TREML1Q86YW5 311 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 OR6T1Q8NGN1 323 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 PIK3IP1Q96FE7 263 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 TPD52L3Q96J77 140 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 NGBQ9NPG2 151 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 RASD1Q9Y272 281 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.63□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 MED12LQ86YW9 2145 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 A0A087WUJ7 227 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 CIB4A0PJX0 185 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 RAMP1O60894 148 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 IGHV3-9P01782 118 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 CCKARP32238 428 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 CDH12P55289 794 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 C1DQ13901 141 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 MFSD13AQ14CX5 517 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 STK11Q15831 433 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 DEF8Q6ZN54 512 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 AAED1Q7RTV5 226 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 P3H2Q8IVL5 708 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 SLC15A3Q8IY34 581 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 GABRG1Q8N1C3 465 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 GPR32P1Q8NGA4 272 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 S100PBPQ96BU1 408 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 ASPNQ9BXN1 380 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 OR10A4Q9H209 315 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 ASB6Q9NWX5 421 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 CMTM6Q9NX76 183 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 USP22Q9UPT9 525 aa14.62□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 TRAPPC13A5PLN9 417 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 ENO4A6NNW6 628 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 NPIPB7O75200 414 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 LYZL6O75951 148 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 ZNF43P17038 809 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 CBLP22681 906 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 CRYGSP22914 178 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 KDELR2P33947 212 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 TAS2R41P59536 307 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 PSME3P61289 254 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 MXRA7P84157 204 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 SLC17A1Q14916 467 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 CARM1Q86X55 608 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 HSD17B8Q92506 261 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 MUCL1Q96DR8 90 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 WFDC6Q9BQY6 131 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 ALG2Q9H553 416 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 ADA2Q9NZK5 511 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.61□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 CXCR6O00574 342 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 CHP2O43745 196 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 HRGP04196 525 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 GGT1P19440 569 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 PTNP21246 168 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 GRPRP30550 384 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 HOXC12P31275 282 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 EGR4Q05215 589 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 FAPQ12884 760 aa14.6□□□□□ -0.07
IGHV3-62-201ENST00000520057 TSC22D1Q15714 1073 aa14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms