RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486032.1

COPS3-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene COPS3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-208ENST00000486032 ZNF407Q9C0G0 2248 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 A0A087WUJ7 227 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 A0A1B0GVC2 190 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 GJE1A6NN92 205 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 ENO4A6NNW6 628 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 A8MVM7 634 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 LRRN3E7EW58 273 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 SULT2B1O00204 365 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 TNFRSF11BO00300 401 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 FAAHO00519 579 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 FFAR1O14842 300 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 BCKDKO14874 412 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 FMO6PO60774 539 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 SEMA7AO75326 666 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 E2F6O75461 281 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 SERPINI2O75830 405 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 KRT36O76013 467 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 AHSA1O95433 338 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 SYNGR4O95473 234 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 CH25HO95992 272 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 ACTL6AO96019 429 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 SEMG1P04279 462 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 PNMTP11086 282 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 IFI30P13284 250 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 RHCEP18577 417 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 CHMP24386 653 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 IDUAP35475 653 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 LHX2P50458 406 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 IST1P53990 364 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 UGT2B15P54855 530 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 CASP6P55212 293 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 CLDN18P56856 261 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 CARD18P57730 90 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 NUP107P57740 925 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 ACTR3P61158 418 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 TMEM44Q2T9K0 475 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 GXYLT1Q4G148 440 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 SYT14P1Q58G82 188 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 SLC25A53Q5H9E4 307 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 VASNQ6EMK4 673 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 OR2T5Q6IEZ7 315 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 PODNL1Q6PEZ8 512 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 TBPL2Q6SJ96 375 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 RPTNQ6XPR3 784 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 ZNF730Q6ZMV8 503 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 FGD2Q7Z6J4 655 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 ATCAYQ86WG3 371 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 OFCC1Q8IZS5 231 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 LSMEM1Q8N8F7 131 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 ICA1LQ8NDH6 482 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 OR2T29Q8NH02 315 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 OR10D3Q8NH80 312 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 OR2V1Q8NHB1 315 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 FAM57AQ8TBR7 257 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 TMEM239Q8WW34 195 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 LRTOMTQ8WZ04 291 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 ROBO4Q8WZ75 1007 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 OSTF1Q92882 214 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 SLC38A4Q969I6 547 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 SLCO4A1Q96BD0 722 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 WDYHV1Q96HA8 205 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 C7orf34Q96L11 122 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 ZNF347Q96SE7 839 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 PIP5K1AQ99755 562 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 SLX1AQ9BQ83 275 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 TUBA1CQ9BQE3 449 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 PRSS27Q9BQR3 290 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 TAPBPLQ9BX59 468 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 SRXN1Q9BYN0 137 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 YY1AP1Q9H869 796 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 REEP1Q9H902 201 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 VNN3Q9NY84 501 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 TINAGQ9UJW2 476 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 TMCC3Q9ULS5 477 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 CLEC4AQ9UMR7 237 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 MED31Q9Y3C7 131 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 AP4S1Q9Y587 144 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 DNAJC13O75165 2243 aa5.05□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.04□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa5.04□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 A0A087WUU8 490 aa5.04□□□□□ -1.6
COPS3-208ENST00000486032 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms