RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880		M0QX08	132 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ATP8B1	O43520	1251 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	RAD51D	O75771	328 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	HTR2A	P28223	471 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	DMTN	Q08495	405 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PDK3	Q15120	406 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	AAED1	Q7RTV5	226 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	SLC35B4	Q969S0	331 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC58	Q96CX6	371 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	MUCL1	Q96DR8	90 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	NANOG	Q9H9S0	305 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	NGB	Q9NPG2	151 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PARPBP	Q9NWS1	579 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	GID8	Q9NWU2	228 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ASB6	Q9NWX5	421 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	GMEB1	Q9Y692	573 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	CAD	P27708	2225 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	MTOR	P42345	2549 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	DSCAM	O60469	2012 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	MFN2	O95140	757 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PNMT	P11086	282 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	GGT1	P19440	569 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV1-2	P23083	117 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	NR1H2	P55055	460 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	OR1Q1	Q15612	314 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	TAB1	Q15750	504 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ULK3	Q6PHR2	472 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	STK35	Q8TDR2	534 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf82	Q8WW14	230 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	HSD17B8	Q92506	261 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	RCN3	Q96D15	328 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	SLC47A1	Q96FL8	570 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	MCHR1	Q99705	422 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880	ARID1A	O14497	2285 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PR80	420 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	AQP7P3	A6NL99	342 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	AIM2	O14862	343 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC22	O60826	627 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ATE1	O95260	518 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	HOXC12	P31275	282 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	PCGF2	P35227	344 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SLC16A1	P53985	500 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	H3F3A	P84243	136 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SLC17A1	Q14916	467 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	PPA1	Q15181	289 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	DUSP7	Q16829	419 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	VMAC	Q2NL98	169 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	KDM8	Q8N371	416 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	OR52N5	Q8NH56	324 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SLC38A4	Q969I6	547 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CCL19	Q99731	98 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	OR10A4	Q9H209	315 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	KLF4	O43474	513 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	PLAU	P00749	431 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CD3E	P07766	207 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SEC24C	P53992	1094 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	COQ5	Q5HYK3	327 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	NIPAL3	Q6P499	406 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA21	Q7Z572	469 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	PROX1	Q92786	737 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	FOXC2	Q99958	501 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		13.07	□□□□□ -0.32
SSR4-208	ENST00000471880	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32

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