RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 CSMD1Q96PZ7 3565 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 AHSA1O95433 338 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 CRYGSP22914 178 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS5P46782 204 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 CRYBA2P53672 197 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 ITGADQ13349 1161 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 POU4F3Q15319 338 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 TSC22D1Q15714 1073 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM225Q6GV28 225 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 Q6ZT83 130 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 CDH24Q86UP0 819 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC15A3Q8IY34 581 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 STEAP2Q8NFT2 490 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 OR6T1Q8NGN1 323 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 RASSF5Q8WWW0 418 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 CMTM5Q96DZ9 223 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 PTDSS2Q9BVG9 487 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 AP3M1Q9Y2T2 418 aa18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 PDZD2O15018 2839 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A087WUJ7 227 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0B4J2E0 115 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GX12 115 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 AQP7P3A6NL99 342 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM220BPB1ANY3 271 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 FMO6PO60774 539 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 THBDP07204 575 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 CDH12P55289 794 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 NPTX1Q15818 432 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 PIGWQ7Z7B1 504 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 P3H2Q8IVL5 708 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2T12Q8NG77 320 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4D11Q8NGI4 311 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 TAAR8Q969N4 342 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 APH1AQ96BI3 265 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 LIME1Q9H400 295 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 PARPBPQ9NWS1 579 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa18.68■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB108AA8MXU0 73 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 FTCDNL1E5RQL4 147 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2T1O43869 369 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNA14P01570 189 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 IL32P24001 234 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 P2RY4P51582 365 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 ENTPD8Q5MY95 495 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXW9Q5XUX1 488 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF613Q6PF04 617 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 C5orf46Q6UWT4 87 aa18.67■□□□□ 0.58
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SH3BP4-204ENST00000416021 GPAT4Q86UL3 456 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2J2Q8N2K1 259 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 ZIC4Q8N9L1 334 aa18.67■□□□□ 0.58
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SH3BP4-204ENST00000416021 S100PBPQ96BU1 408 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 CSMD2Q7Z408 3487 aa18.67■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 ELOVL7A1L3X0 281 aa18.66■□□□□ 0.58
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SH3BP4-204ENST00000416021 VAMP5O95183 116 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3-9P01782 118 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 KDELR2P33947 212 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 LIPEQ05469 1076 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 HACD2Q6Y1H2 254 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 MICU2Q8IYU8 434 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 OR9K2Q8NGE7 335 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 PROX1Q92786 737 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 PIK3IP1Q96FE7 263 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 BAG5Q9UL15 447 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 RASD1Q9Y272 281 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 SH3GLB1Q9Y371 365 aa18.66■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 CREBBPQ92793 2442 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 KLF4O43474 513 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 LYZL6O75951 148 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV1-2P23083 117 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 PRDX6P30041 224 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 NUDT2P50583 147 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM69AQ5T7M9 428 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 ALKBH2Q6NS38 261 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00114Q6XXX2 140 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 WFDC8Q8IUA0 241 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 HSD17B8Q92506 261 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa18.65■□□□□ 0.58
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PPR1 153 aa18.64■□□□□ 0.57
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