RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MOGAT1Q96PD6 335 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LPAR4Q99677 370 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LAT2Q9GZY6 243 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXO8Q9NRD0 319 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 BAIAP2Q9UQB8 552 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF337Q9Y3M9 751 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa3.63□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ALPK2Q86TB3 2170 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CFAP54Q96N23 3096 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SMIM30A4D0T7 59 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM221A6NGB7 291 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ALG1L2C9J202 215 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 D6RAR5 112 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 M0R296 226 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 IMPA2O14732 288 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC30A4O14863 429 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MAGEB3O15480 346 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CDRT1O95170 752 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 F13BP05160 661 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CCL4P13236 92 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF28P17035 718 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CXCR1P25024 350 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 EVI2BP34910 448 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HOXD12P35452 270 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXW4P57775 412 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 EGR4Q05215 589 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LTBQ06643 244 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TPBGQ13641 420 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP1A4Q13733 1029 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC23A3Q6PIS1 610 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MFSD4AQ8N468 514 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF441Q8N8Z8 693 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FNDC8Q8TC99 324 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RASD2Q96D21 266 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DACH2Q96NX9 599 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NMNAT3Q96T66 252 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF649Q9BS31 505 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KATNB1Q9BVA0 655 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ALG8Q9BVK2 526 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TMED9Q9BVK6 235 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HDHD5Q9BXW7 423 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TTTY10Q9BZA0 68 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CHRNA9Q9UGM1 479 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SAGE2PA6NJ88 616 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CTDSP2O14595 271 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RGS5O15539 181 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 FADS1O60427 444 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 WISP1O95388 367 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HIST1H2ABP04908 130 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SBK2P0C263 348 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CLEC2LP0C7M8 214 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 GP1BBP13224 206 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PGCP20142 388 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 RPS5P46782 204 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC6A8P48029 635 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TGM4P49221 684 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HCCSP53701 268 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 CTXN1P60606 82 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 PRPS1P60891 318 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF74Q16587 644 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 C1QL3Q5VWW1 255 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SYT14Q8NB59 555 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 AGBL5Q8NDL9 886 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 OR5W2Q8NH69 310 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SMPDL3BQ92485 455 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 HIST1H2ACQ93077 130 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 MR1Q95460 341 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 TP53INP1Q96A56 240 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.62□□□□□ -1.83
LRRTM4-201ENST00000409088 Q96M85 177 aa3.62□□□□□ -1.83
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