RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362356.1

RNU6-50P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 50, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-50P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-50P-201ENST00000362356 AMTP48728 403 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 PCYT1AP49585 367 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 CRISP1P54107 249 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 NUP107P57740 925 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 HERV-K104P61576 105 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 DGCR2P98153 550 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ZNF85Q03923 595 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 TSPAN31Q12999 210 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 STX5Q13190 355 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 SGCAQ16586 387 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 IMPG1Q17R60 797 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 SPATS1Q496A3 300 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 FAM106AQ4KMX7 169 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ACTBL2Q562R1 376 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 TPRG1LQ5T0D9 272 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 EMBQ6PCB8 327 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 Q6YL49 198 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 C3P1Q6ZMU1 363 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ZNF730Q6ZMV8 503 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ZNF793Q6ZN11 406 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 C9orf139Q6ZV77 190 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 LIMS2Q7Z4I7 341 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 CRLF3Q8IUI8 442 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ZBED8Q8IZ13 594 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 OR52H1Q8NGJ2 320 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 OR2L2Q8NH16 312 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 FBXO25Q8TCJ0 367 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 RORBQ92753 470 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 TOMM40LQ969M1 308 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 NEIL2Q969S2 332 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 CXorf40BQ96DE9 158 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 SDSLQ96GA7 329 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 MBOAT7Q96N66 472 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 PSD2Q9BQI7 771 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 OVOL2Q9BRP0 275 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 NICN1Q9BSH3 213 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 SLC25A33Q9BSK2 321 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ZNF426Q9BUY5 554 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 MLST8Q9BVC4 326 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 FAIM2Q9BWQ8 316 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ZYG11BQ9C0D3 744 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 MMP28Q9H239 520 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 SP140LQ9H930 580 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 BFARQ9NZS9 450 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 PDE10AQ9Y233 779 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 COL4A3Q01955 1670 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 GOLGA6L10A6NI86 522 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ZNF587BE7ETH6 402 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 LRRN3E7EW58 273 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 H0YHG0 523 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 H3BQV1 296 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ATP6V0E1O15342 81 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 SGCEO43556 437 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 CYTH3O43739 400 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 CXCL13O43927 109 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 HPP00738 406 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 TIMP1P01033 207 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 OXTP01178 125 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 IFNA6P05013 189 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 HLA-DOBP13765 273 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 EDNRAP25101 427 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 HLA-DMAP28067 261 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 CALCRP30988 508 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 MAS1LP35410 378 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 SAA4P35542 130 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 OR3A2P47893 321 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 CSNK1A1P48729 337 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 PLK1P53350 603 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 MLF1P58340 268 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ATP6V0D1P61421 351 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ID2Q02363 134 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 TFF2Q03403 129 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 GLO1Q04760 184 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ZNF33AQ06730 810 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ZNF33BQ06732 778 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 SCRN3Q0VDG4 424 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 MADCAM1Q13477 382 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 GPR18Q14330 331 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 GNMTQ14749 295 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 PSG5Q15238 335 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 CD226Q15762 336 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-50P-201ENST00000362356 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms