RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 ZNF235Q14590 738 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SLC25A52Q3SY17 297 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TTC23Q5W5X9 447 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PNCKQ6P2M8 343 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SCYL2Q6P3W7 929 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TRIM65Q6PJ69 517 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 P4HA3Q7Z4N8 544 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 RAB43Q86YS6 212 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 KIRREL3Q8IZU9 778 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ZADH2Q8N4Q0 377 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CCL4L1Q8NHW4 92 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 C8orf46Q8TAG6 207 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NT5C3BQ969T7 300 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PNPLA2Q96AD5 504 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SLC25A36Q96CQ1 311 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 LRR1Q96L50 414 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TGM7Q96PF1 710 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CPXM1Q96SM3 734 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NLNQ9BYT8 704 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FN3KRPQ9HA64 309 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 APMAPQ9HDC9 416 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 MED17Q9NVC6 651 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 WIPI2Q9Y4P8 454 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SNX10Q9Y5X0 201 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TRPM6Q9BX84 2022 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 A0A1B0GUH1 482 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 OR5K4A6NMS3 321 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PDZK1P1A8MUH7 402 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 C9J4A7 227 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SH2D1BO14796 132 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 RHBDL1O75783 438 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NADKO95544 446 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CLDN1O95832 211 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 HPRP00739 348 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 IGHEP01854 428 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CRYABP02511 175 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FGF1P05230 155 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CYP11B1P15538 503 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 MMP12P39900 470 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TPI1P60174 286 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NAAAQ02083 359 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ACY1Q03154 408 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SRYQ05066 204 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 PARP15Q460N3 678 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 Q6ZRG5 221 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CREB3L2Q70SY1 520 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TUBA1AQ71U36 451 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 UBQLNLQ8IYU4 475 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NAGSQ8N159 534 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 MARVELD2Q8N4S9 558 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SCARB1Q8WTV0 552 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CXorf40BQ96DE9 158 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 UHRF2Q96PU4 802 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 GSDMAQ96QA5 445 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 NPY6RQ99463 290 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TUBA1CQ9BQE3 449 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SLC39A3Q9BRY0 314 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 GON7Q9BXV9 100 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 C3orf14Q9HBI5 128 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 LHX9Q9NQ69 397 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TMEM9Q9P0T7 183 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.76□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TEX15Q9BXT5 2789 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 LOC105371242A0A075B767 164 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 DFFAO00273 331 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 LRRTM2O43300 516 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 ZMPSTE24O75844 475 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TOMM40O96008 361 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 SERPINA3P01011 423 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FCER2P06734 321 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 IVLP07476 585 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 CCDC159P0C7I6 412 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 UQCRBP14927 111 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 TSPAN8P19075 237 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 HNF1AP20823 631 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 GALP22466 123 aa4.75□□□□□ -1.65
CCL20-201ENST00000358813 FEN1P39748 380 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms