RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 FZD7O75084 574 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 BTCP35070 178 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 HCCSP53701 268 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 PYHIN1Q6K0P9 492 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF767PQ75MW2 155 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 GUCD1Q96NT3 240 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 SEMA6CQ9H3T2 930 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ICAM5Q9UMF0 924 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 DTX4Q9Y2E6 619 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A0A6YYJ9 748 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB3BP20337 219 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ELOCQ15369 112 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ULK3Q6PHR2 472 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 KIRREL2Q6UWL6 708 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM151BQ8IW70 566 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 GHDCQ8N2G8 530 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 LRFN5Q96NI6 719 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL1Q9NR64 748 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 HSPB11Q9Y547 144 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ALPK2Q86TB3 2170 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5K4A6NMS3 321 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 NPIPB9F8W1W9 429 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 PGDP52209 483 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM53BQ14153 422 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF141Q15928 474 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 TP53I3Q53FA7 332 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 SDR9C7Q8NEX9 313 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4K13Q8NH42 304 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 PELI1Q96FA3 418 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 VSTM2LQ96N03 204 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PRG6 482 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2T7P0C7T2 308 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 GGTLC2Q14390 218 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 FGFBP1Q14512 234 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 HACD4Q5VWC8 232 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2T27Q8NH04 317 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 CACNG2Q9Y698 323 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFB2O95178 105 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC36A2Q495M3 483 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF550Q7Z398 422 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 SYS1Q8N2H4 156 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5H6Q8NGV6 325 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 THAP4Q8WY91 577 aa17.18■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 C7orf66A4D0T2 115 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 FOXS1O43638 330 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPINA3P01011 423 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 OR1D4P47884 311 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP78Q5JTW2 689 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM205BPQ63HN1 556 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 POMGNT2Q8NAT1 580 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC9Q92623 222 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 RIT1Q92963 219 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 SMIM19Q96E16 107 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 SCMH1Q96GD3 660 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 TTTY10Q9BZA0 68 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 HEATR5AQ86XA9 2040 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 A8MUA0 341 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 MCIDASD6RGH6 385 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 CAPZBP47756 277 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 CDK5R1Q15078 307 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 FCN2Q15485 313 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 NPSR1Q6W5P4 371 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 C9orf62Q8N4C0 152 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 RCBTB1Q8NDN9 531 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 GHITMQ9H3K2 345 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 LRIT1Q9P2V4 623 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 RNF215Q9Y6U7 377 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ATF1P18846 271 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 GDI2P50395 445 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTA2P62736 377 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTG2P63267 376 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 NTRK2Q16620 822 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 CDONQ4KMG0 1287 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 LRRC17Q8N6Y2 441 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 OR51L1Q8NGJ5 315 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 RELTQ969Z4 430 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 MFRPQ9BY79 579 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 FABP7O15540 132 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP1-201ENST00000357436 DHFRP00374 187 aa17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms