RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 NNATQ16517 81 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 NDUFAF6Q330K2 333 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 RFLNBQ8N5W9 214 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.467e-8■■□□□ 11.5
SPNS1-201ENST00000311008 HSPA12BQ96MM6 686 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 ABHD1Q96SE0 405 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 ORAI3Q9BRQ5 295 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 EPHA6Q9UF33 1036 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 C2CD4DB7Z1M9 353 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 MMP15P51511 669 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 FAPQ12884 760 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 ASB18Q6ZVZ8 466 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 OR51L1Q8NGJ5 315 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 LILRB4Q8NHJ6 448 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 GRPEL2Q8TAA5 225 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 BEX2Q9BXY8 128 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa17.9■□□□□ 0.46
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1B0GTQ1 180 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 IMPA2O14732 288 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 LANCL1O43813 399 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SCO2O43819 266 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 DHFRP00374 187 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 GZMKP49863 264 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SLC25A1P53007 311 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 MAB21L1Q13394 359 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 HSD17B12Q53GQ0 312 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 YIF1BQ5BJH7 314 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 UTS2BQ765I0 119 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 PLCZ1Q86YW0 608 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 OR13C5Q8NGS8 318 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ZFAND1Q8TCF1 268 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 GON7Q9BXV9 100 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 NDEL1Q9GZM8 345 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 PDE7BQ9NP56 450 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 COPZ2Q9P299 210 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SPATA2Q9UM82 520 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 MOKQ9UQ07 419 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 HIF3AQ9Y2N7 669 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM131Q92545 1883 aa17.89■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 FITM1A5D6W6 292 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 OR6C68A6NDL8 312 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 LRRN3E7EW58 273 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 PDCD5O14737 125 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF217O75362 1048 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 IL33O95760 270 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 UBL4AP11441 157 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 CEP78Q5JTW2 689 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 FNDC7Q5VTL7 733 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SLC6A19Q695T7 634 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 MED25Q71SY5 747 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SYT13Q7L8C5 426 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 NUP54Q7Z3B4 507 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 OR6K6Q8NGW6 343 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 RPS4Y2Q8TD47 263 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 DPAGT1Q9H3H5 408 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 LRRN3Q9H3W5 708 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 CAMK2AQ9UQM7 478 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 REV3LO60673 3130 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 TLCD2A6NGC4 264 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 C17orf105B2RV13 164 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SCDO00767 359 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF9O43307 516 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 CLPSP04118 112 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 TFPIP10646 304 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 NME1P15531 152 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ATF1P18846 271 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 PPICP45877 212 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 FNTBP49356 437 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ERVK-25P63136 954 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 TNK1Q13470 666 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 GRM7Q14831 915 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 NTRK2Q16620 822 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 JAZF1Q86VZ6 243 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 C7orf57Q8NEG2 295 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SLC46A1Q96NT5 459 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 BRD7Q9NPI1 651 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 SOHLH2Q9NX45 425 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 MMACHCQ9Y4U1 282 aa17.88■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 CD14P08571 375 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 CD1CP29017 333 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF74Q16587 644 aa17.87■□□□□ 0.45
SPNS1-201ENST00000311008 Q6ZS52 159 aa17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms