RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251691.4

ARFGEF3-201, Transcript of ARFGEF family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARFGEF3, Length 14,877 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3-201ENST00000251691 TMEM18Q96B42 140 aa6.86□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.86□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.86□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.86□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 A0A1W2PPV4 95 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 SNCAP37840 140 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 FASLGP48023 281 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 XAF1Q6GPH4 301 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 OGFOD3Q6PK18 319 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 CCDC190Q86UF4 302 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 V9GYS6 101 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 A0A0U1RQS6 177 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 CR2P20023 1033 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 HOXC12P31275 282 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 COMMD1Q8N668 190 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 OR9A2Q8NGT5 310 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 NUDT8Q8WV74 236 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 HMGCLP35914 325 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 MC3RP41968 323 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 MANEALQ5VSG8 457 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 SYT17Q9BSW7 474 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 ZNF30P17039 623 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 FUT1P19526 365 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 DSC1Q08554 894 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 SYT14P1Q58G82 188 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 SBSNQ6UWP8 590 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 OR7D2Q96RA2 312 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 CSF3RQ99062 836 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 OR52D1Q9H346 318 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 ELOVL3Q9HB03 270 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 ZNF724A8MTY0 619 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 COX20Q5RI15 118 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 OR8D2Q9GZM6 311 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 RHOFQ9HBH0 211 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 KCNJ5P48544 419 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 FJX1Q86VR8 437 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 SCMH1Q96GD3 660 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 A0A087WV62 115 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 HIDE1A8MVS5 230 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 XRCC3O43542 346 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 RAC2P15153 192 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 SEC13P55735 322 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 GRM7Q14831 915 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 SUSD3Q96L08 255 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 RHNO1Q9BSD3 238 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 DKKL1Q9UK85 242 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 HHLA1C9JL84 531 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 OR1S2Q8NGQ3 325 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 C1orf226A1L170 272 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 GABARAPH6UMI1 98 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 PIRO00625 290 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 MLF1P58340 268 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 DEFB134Q4QY38 66 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 ETV7Q9Y603 341 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 A6NIZ1 184 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 CDK2AP1O14519 115 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 PAPLNO95428 1278 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 PTTG1IPP53801 180 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 TAS2R30P59541 319 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 RAP1BP61224 184 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 RPS18P62269 152 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 OR8U1Q8NH10 309 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 ZNF566Q969W8 418 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.85□□□□□ -1.31
ARFGEF3-201ENST00000251691 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms