RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 C20orf85Q9H1P6 137 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 NME4O00746 187 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 SULT1C4O75897 302 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 GABRA2P47869 451 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 SPCS2Q15005 226 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 NDUFAF7Q7L592 441 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 WNT6Q9Y6F9 365 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 RAB5AP20339 215 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 RAC1P63000 192 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 NOGQ13253 232 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 CEACAM7Q14002 265 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 PQLC3Q8N755 202 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 MARC2Q969Z3 335 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 FBXL2Q9UKC9 423 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 HHLA2Q9UM44 414 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 OR8U8P0C7N1 319 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 TCTE1Q5JU00 501 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 NADSYN1Q6IA69 706 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 MFSD6LQ8IWD5 586 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 OSGIN1Q9UJX0 560 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 BCL9O00512 1426 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 TO15178 435 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 RD3LP0DJH9 198 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 NTF3P20783 257 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 PTTG1IPP53801 180 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 GPM6BQ13491 265 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 TMIGD2Q96BF3 282 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 S100A8P05109 93 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 EMP2P54851 167 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 OPCMLQ14982 345 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.023e-6■■■■□ 24
TNS1-201ENST00000171887 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 OR10Z1Q8NGY1 313 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 ETV7Q9Y603 341 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 SCN4AP35499 1836 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 UMAD1C9J7I0 102 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 VIPR2P41587 438 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 SLC7A9P82251 487 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 PAGE3Q5JUK9 113 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 SIGLEC10Q96LC7 697 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 PIGMQ9H3S5 423 aa8.68□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 GABRPO00591 440 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 SNNO75324 88 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 ADRB1P08588 477 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 CT45A10P0DMU9 189 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 CATR1Q13166 79 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 ILKQ13418 452 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 HBMQ6B0K9 141 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 CENPOQ9BU64 300 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 WIF1Q9Y5W5 379 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 MROH1Q8NDA8 1641 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 ZNF487B1APH4 448 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 DPP4P27487 766 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 SH3BP2P78314 561 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 H3F3AP84243 136 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 IKZF1Q13422 519 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 BCL7AQ4VC05 210 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 FAM180BQ6P0A1 224 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 OR7G3Q8NG95 312 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 TMEM163Q8TC26 289 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 CLDND1Q9NY35 253 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 B4GALT6Q9UBX8 382 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 DDAH2O95865 285 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 OR13C7P0DN81 318 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 S100A11P31949 105 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 SLC1A3P43003 542 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 SELPLGQ14242 412 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 FAM57BQ71RH2 274 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 DOK4Q8TEW6 326 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 RAB7BQ96AH8 199 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 RAB3CQ96E17 227 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 GPR160Q9UJ42 338 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.67□□□□□ -1.02
TNS1-201ENST00000171887 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms