RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	SAP190	P36123	1033 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	SAK1	P38990	1142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	SSY5	P47002	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	STB4	P50104	949 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	DAM1	P53267	343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	MUK1	Q02866	612 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	NNF1	P47149	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	MET7	Q08645	548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
PEX18	YHR160C	GAL11	P19659	1081 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	PER1	P25625	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	SPC29	P33419	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	PZF1	P39933	429 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	ELO3	P40319	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	MUP1	P50276	574 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	PKH1	Q03407	766 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	DLT1	Q04216	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	YDR514C	Q04408	483 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	FRE5	Q08908	694 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PEX18	YHR160C	MET3	P08536	511 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	PPS1	P38148	807 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	PFA3	P42836	336 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	UBA2	P52488	636 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	ASM4	Q05166	528 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	RSC3	Q06639	885 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	THI21	Q08975	551 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	HXT16	P47185	567 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	ATP25	Q03153	612 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	TMN2	Q04562	672 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	REH1	Q06709	432 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	MCH5	Q08777	521 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	YBR053C	P38235	358 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	OMS1	Q06668	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	GPR1	Q12361	961 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	YLR415C	O13578	112 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	GDH3	P39708	457 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	SHR5	P41912	237 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	GIS1	Q03833	894 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	ADY4	Q05955	493 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	ACF2	Q12168	779 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	MAL11	P53048	616 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	NRG1	Q03125	231 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	CRR1	Q05790	422 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	YOR131C	Q12486	218 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	DIF1	O13577	133 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	NGG1	P32494	702 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	TIM23	P32897	222 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	ZIP2	P53061	704 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	YDR338C	Q05497	695 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	TGL5	Q12043	749 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PEX18	YHR160C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.77	□□□□□ -1.65	not detected
PEX18	YHR160C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	YJL163C	P46996	555 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	ALY2	P47029	1046 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	GND2	P53319	492 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	MTH1	P35198	433 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	OCA5	P38738	679 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	TIM44	Q01852	431 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	IRC13	Q08630	104 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	ATG2	P53855	1592 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	SSN2	P38931	1420 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	BUD6	P41697	788 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	AMA1	P50082	593 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	RPN4	Q03465	531 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	MTC2	P34246	357 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	SPC42	P36094	363 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	SIC1	P38634	284 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	YIR042C	P40586	236 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	IRC10	Q08118	586 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	REV3	P14284	1504 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	MCD4	P36051	919 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	YHL017W	P38745	532 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	HOS4	P40480	1083 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	SDS3	P40505	327 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	CDC9	P04819	755 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
PEX18	YHR160C	PCL5	P38794	229 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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