RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 GNAQP50148 359 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 HAND2P61296 217 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 MICU3Q86XE3 530 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 CYP7A1P22680 504 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.56■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 TMEM2Q9UHN6 1383 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 NEMFO60524 1076 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 PLEKHG3A1L390 1219 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 POTEJP0CG39 1038 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 PPP4R3AQ6IN85 833 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 BRF1Q92994 677 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 PAG1Q9NWQ8 432 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 CALML4Q96GE6 196 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 DNAI2Q9GZS0 605 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 ZBTB43O43298 467 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 KIAA1328Q86T90 577 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 RBM25P49756 843 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 STX1AQ16623 288 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 KLHL40Q2TBA0 621 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.54■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP15.54■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 MYO1BO43795 1136 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 TAF4BQ92750 862 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 PTPRTO14522 1441 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 ARHGEF10O15013 1369 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 GOLGA6L10A6NI86 522 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 TOP1P11387 765 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 RLBP1P12271 317 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 SPA17Q15506 151 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 VPS36Q86VN1 386 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 ANKRD2Q9GZV1 360 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 CHL1O00533 1208 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 UVSSAQ2YD98 709 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC148Q8NFR7 591 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 C8orf37Q96NL8 207 aa15.53■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC102BQ68D86 513 aa15.52■□□□□ 0.08
PTPRVP-205ENST00000641549 PLCG2P16885 1265 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 UBA7P41226 1012 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF790Q6PG37 636 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 GSDMDP57764 484 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 KLHL10Q6JEL2 608 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 FEZ1Q99689 392 aa15.52■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.51■□□□□ 0.072e-6■□□□□ 8.3
PTPRVP-205ENST00000641549 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CALM1P0DP23 149 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CALM2P0DP24 149 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CALM3P0DP25 149 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 HSPA2P54652 639 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PARP10Q53GL7 1025 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CETN2P41208 172 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 ABCA8O94911 1581 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 TSPY3P0CV98 308 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 TSPY8P0CW00 308 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 RTN1Q16799 776 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 MPNDQ8N594 471 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 KRT24Q2M2I5 525 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CKAP2LQ8IYA6 745 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRVP-205ENST00000641549 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms