RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 ZSCAN30Q86W11 494 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 USP16Q9Y5T5 823 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 AMPD3Q01432 767 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 TMX3Q96JJ7 454 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 RTL9Q8NET4 1388 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 FKBP15Q5T1M5 1219 aa7.49□□□□□ -1.21
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PDE4D-228ENST00000636120 TTLL5Q6EMB2 1281 aa7.49□□□□□ -1.21
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PDE4D-228ENST00000636120 ERVK-7P63135 1459 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 TRAF1Q13077 416 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.49□□□□□ -1.21
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PDE4D-228ENST00000636120 ZNF804AQ7Z570 1209 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 FERMT3Q86UX7 667 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 ABCC3O15438 1527 aa7.49□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 UGGT1Q9NYU2 1555 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-228ENST00000636120 GSDMDP57764 484 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 TSPYL6Q8N831 410 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 ANKRD2Q9GZV1 360 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 CHL1O00533 1208 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 CALM1P0DP23 149 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 CALM2P0DP24 149 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 CALM3P0DP25 149 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 CFAP100Q494V2 611 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 LMBR1LQ6UX01 489 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-228ENST00000636120 CNNM3Q8NE01 707 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 HELLSQ9NRZ9 838 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 TSPOAP1O95153 1857 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 SLC39A6Q13433 755 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC96Q2M329 555 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 ESPNB1AK53 854 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 DESP17661 470 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 WTAPQ15007 396 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 FSIP1Q8NA03 581 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 ESR2Q92731 530 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-228ENST00000636120 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.48□□□□□ -1.21
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PDE4D-228ENST00000636120 SKAP1Q86WV1 359 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 NLRP3Q96P20 1036 aa7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 TSPY2A6NKD2 308 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
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PDE4D-228ENST00000636120 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 CALML4Q96GE6 196 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 ANXA1P04083 346 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 KCNG4Q8TDN1 519 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 RMND1Q9NWS8 449 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 C6orf229H3BNL8 230 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 RLBP1P12271 317 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 PDCL3Q9H2J4 239 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 LAMC1P11047 1609 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 RNF123Q5XPI4 1314 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 POTEJP0CG39 1038 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 KIAA1328Q86T90 577 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 SLC52A2Q9HAB3 445 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 CABP5Q9NP86 173 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa7.47□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB43O43298 467 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 PARP10Q53GL7 1025 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 PIBF1Q8WXW3 757 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 PLA2R1Q13018 1463 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 PLCG2P16885 1265 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 CYP7A1P22680 504 aa7.46□□□□□ -1.21
PDE4D-228ENST00000636120 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.46□□□□□ -1.21
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