RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 COPS6Q7L5N1 327 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 PGAP2Q9UHJ9 254 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF1P21675 1872 aa31.34■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 SP8Q8IXZ3 490 aa31.33■■■□□ 2.61
CAPNS1-216ENST00000628306 BBOX1O75936 387 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 XAGE3Q8WTP9 111 aa31.32■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 TMPOP42166 694 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA2012Q0VF49 1180 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD8Q96I13 439 aa31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 TCIRG1Q13488 830 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT24Q2M2I5 525 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 SUPT20HQ8NEM7 779 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 NECTIN2Q92692 538 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC37AA6NMS7 1700 aa31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 YDJCA8MPS7 323 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 ECE1P42892 770 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 SAPCD2Q86UD0 394 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 MPNDQ8N594 471 aa31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP31.29■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 COL4A1P02462 1669 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 AOC2O75106 756 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa31.28■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 SHTN1A0MZ66 631 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 GRAPQ13588 217 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 CIAPIN1Q6FI81 312 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPM4Q8TD43 1214 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTS8Q9UP79 889 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 CDHR2Q9BYE9 1310 aa31.27■■■□□ 2.6
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD17O75943 681 aa31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 CHL1O00533 1208 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 GRM1Q13255 1194 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3TC1Q8TE82 1336 aa31.25■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 CELF2O95319 508 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP2K2P36507 400 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF428Q96B54 188 aa31.23■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 LMOD3Q0VAK6 560 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 HHIPL1Q96JK4 782 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 CHPF2Q9P2E5 772 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 TSKSQ9UJT2 592 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM35Q9UPQ4 493 aa31.21■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 ISCA1Q9BUE6 129 aa31.2■■■□□ 2.59
CAPNS1-216ENST00000628306 TNIP1Q15025 636 aa31.19■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 DLK2Q6UY11 383 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC146Q8IYE0 955 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL2L13Q9BXK5 485 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TMC4Q7Z404 712 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 PLBD2Q8NHP8 589 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 BEGAINQ9BUH8 593 aa31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 MICALL2Q8IY33 904 aa31.16■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 EGFRP00533 1210 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC37L1Q7L3B6 337 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM89AQ96GI7 184 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ZIC5Q96T25 663 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 POLLQ9UGP5 575 aa31.15■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMD14O00487 310 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 NEUROD2Q15784 382 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 DPF2Q92785 391 aa31.14■■■□□ 2.58
CAPNS1-216ENST00000628306 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM161AQ3B820 660 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa31.13■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 SAMD7Q7Z3H4 446 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF408Q9H9D4 720 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 DBNDD1Q9H9R9 158 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNQ5Q9NR82 932 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 RTL9Q8NET4 1388 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXB7P09629 217 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 GPSM2P81274 684 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 USP48Q86UV5 1035 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 WASHC4Q2M389 1173 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 SCN9AQ15858 1988 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 H7C1D1 291 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 RGS19P49795 217 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 CA12O43570 354 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 RUNDC1Q96C34 613 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-216ENST00000628306 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
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