RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 UTYO14607 1347 aa10.69□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 CDHR2Q9BYE9 1310 aa10.69□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 CASP7P55210 303 aa10.69□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 EXOC6Q8TAG9 804 aa10.69□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.69□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 KIF13BQ9NQT8 1826 aa10.69□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 SPEF2Q9C093 1822 aa10.68□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 GNAI2P04899 355 aa10.68□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 SUCLG2Q96I99 432 aa10.68□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 SPON1Q9HCB6 807 aa10.68□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 HDAC5Q9UQL6 1122 aa10.68□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 CACNA1SQ13698 1873 aa10.68□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
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SGMS1-211ENST00000626236 RIC1Q4ADV7 1423 aa10.67□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 C10orf71Q711Q0 1435 aa10.67□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 TAF1P21675 1872 aa10.66□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 PDE8AO60658 829 aa10.66□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 PTGER2P43116 358 aa10.66□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 FOXO4P98177 505 aa10.66□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 EPHA10Q5JZY3 1008 aa10.66□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 SLC10A5Q5PT55 438 aa10.66□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 KAZALD1Q96I82 304 aa10.66□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 NLRP3Q96P20 1036 aa10.66□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.66□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 PLA2G12BQ9BX93 195 aa10.66□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.66□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa10.65□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 CTSWP56202 376 aa10.65□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 LMBR1LQ6UX01 489 aa10.65□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.65□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 KLHL34Q8N239 644 aa10.65□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD44Q8N8A2 993 aa10.65□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 BRIP1Q9BX63 1249 aa10.65□□□□□ -0.7
SGMS1-211ENST00000626236 PDE6BP35913 854 aa10.64□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 AAMPQ13685 434 aa10.64□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 TTLL11Q8NHH1 800 aa10.64□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 LRP5O75197 1615 aa10.64□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 SRGAP3O43295 1099 aa10.63□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 CSF1RP07333 972 aa10.63□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 FAM161AQ3B820 660 aa10.63□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC152Q4G0S7 254 aa10.63□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 CEP85Q6P2H3 762 aa10.63□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 C2CD5Q86YS7 1000 aa10.63□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 PLCD3Q8N3E9 789 aa10.63□□□□□ -0.71
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SGMS1-211ENST00000626236 GREM2Q9H772 168 aa10.63□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 COL4A1P02462 1669 aa10.63□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 ATP8B2P98198 1209 aa10.62□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 CRY2Q49AN0 593 aa10.62□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.62□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 H0YIN7 160 aa10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 ITGA6P23229 1130 aa10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 CHRNA5P30532 468 aa10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 MTX1Q13505 466 aa10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC57Q2TAC2 916 aa10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.71
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SGMS1-211ENST00000626236 SEC31BQ9NQW1 1179 aa10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 RTL9Q8NET4 1388 aa10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GUL6 1792 aa10.6□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 SRGNP10124 158 aa10.6□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 NPR1P16066 1061 aa10.6□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.6□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 SIRT2Q8IXJ6 389 aa10.6□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 KLHDC4Q8TBB5 520 aa10.6□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 MASTLQ96GX5 879 aa10.6□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa10.6□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 CD2APQ9Y5K6 639 aa10.6□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0G2JLW4 131 aa10.59□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 HMMRO75330 724 aa10.59□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 DPEP1P16444 411 aa10.59□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 TGFB2P61812 414 aa10.59□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 ERICH6BQ5W0A0 696 aa10.59□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 STYK1Q6J9G0 422 aa10.59□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 SSH3Q8TE77 659 aa10.59□□□□□ -0.71
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
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