RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC171Q6TFL3 1326 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 SLC39A6Q13433 755 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 RUFY3Q7L099 469 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 GPS2Q13227 327 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 MTMR6Q9Y217 621 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 PIK3R4Q99570 1358 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 ALKQ9UM73 1620 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CHL1O00533 1208 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CLGNO14967 610 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CCZ1BP86790 482 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 PTPN21Q16825 1174 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 RASEFQ8IZ41 740 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 BICD2Q8TD16 824 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CARD6Q9BX69 1037 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 PDRG1Q9NUG6 133 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 DNAI1Q9UI46 699 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 NR1I2O75469 434 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 URI1O94763 535 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CHMLP26374 656 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 ISM2Q6H9L7 571 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 MNS1Q8NEH6 495 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 RGS12O14924 1447 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1B0GUL7 405 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 EYA1Q99502 592 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 RTL1A6NKG5 1358 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CPS1P31327 1500 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 GNAI2P04899 355 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 FOSBP53539 338 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 CDC37L1Q7L3B6 337 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-211ENST00000618610 H3BQF6 201 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 TBC1D8O95759 1140 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 TCEANC2Q96MN5 208 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 PHACTR2O75167 634 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 SPG7Q9UQ90 795 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 BECN2A8MW95 431 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 NUTM1Q86Y26 1132 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 KLHDC4Q8TBB5 520 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 DEF6Q9H4E7 631 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 VPS18Q9P253 973 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ATP7BP35670 1465 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA8FQ08AF8 430 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 FMNL2Q96PY5 1086 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 LRRCC1Q9C099 1032 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 STRCQ7RTU9 1775 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CHGBP05060 677 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 CCT4P50991 539 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 EVCP57679 992 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 FAM193AP78312 1265 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 MYL6BP14649 208 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 ATP2B1P20020 1258 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 PSME1Q06323 249 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 MCM6Q14566 821 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 GOLGA5Q8TBA6 731 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 AK7Q96M32 723 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 SNX14Q9Y5W7 946 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 EID1Q9Y6B2 187 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 GNAI3P08754 354 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-211ENST00000618610 KRT85P78386 507 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms