RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617399.1

NBR1-208, Transcript of NBR1, autophagy cargo receptor, human

Gene NBR1, Length 63 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NBR1-208	ENST00000617399	COX20	Q5RI15	118 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	FAM35A	Q86V20	835 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	NACC1	Q96RE7	527 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		7.43	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	7.43	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	RARA	P10276	462 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	TREML1	Q86YW5	311 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		7.42	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	SELP	P16109	830 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	PLAUR	Q03405	335 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	PERM1	Q5SV97	790 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		7.41	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	ELN	P15502	786 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	GPLD1	P80108	840 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	GRIK5	Q16478	980 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	PCSK7	Q16549	785 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	XP32	Q5T750	250 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	ILDR2	Q71H61	639 aa		7.4	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
NBR1-208	ENST00000617399	C9orf172	C9J069	976 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	XYLB	O75191	536 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	EGFR	P00533	1210 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	RAC1	P63000	192 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	FAM26D	Q5JW98	314 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		7.39	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	ATG7	O95352	703 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	ADGRE1	Q14246	886 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	MBTPS1	Q14703	1052 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	MSL1	Q68DK7	614 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	C16orf46	Q6P387	395 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	ZMYND15	Q9H091	742 aa		7.38	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	NRL	P54845	237 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399		Q8N3U1	123 aa		7.37	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	DYRK3	O43781	588 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	MMP20	O60882	483 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	COL26A1	Q96A83	441 aa		7.36	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399		J3QW42	95 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	TNFRSF10B	O14763	440 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	TTC9	Q92623	222 aa		7.35	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	PSAP	P07602	524 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	SLAIN2	Q9P270	581 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	USP21	Q9UK80	565 aa		7.34	□□□□□ -1.23
NBR1-208	ENST00000617399	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	SIK1	P57059	783 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	FBXO11	Q86XK2	927 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	PLD4	Q96BZ4	506 aa		7.33	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	ARID3C	A6NKF2	412 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	NLRP13	Q86W25	1043 aa		7.32	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	GHRH	P01286	108 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	SOX18	P35713	384 aa		7.31	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	ZBTB39	O15060	712 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	ZAP70	P43403	619 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		7.3	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
NBR1-208	ENST00000617399	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		7.3	□□□□□ -1.24

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