RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 BICD1Q96G01 975 aa23.23■■□□□ 1.31
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CTDP1-208ENST00000613122 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.23■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.22■■□□□ 1.31
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CTDP1-208ENST00000613122 GCP02774 474 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDP1-208ENST00000613122 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
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CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB43O43298 467 aa23.22■■□□□ 1.31
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CTDP1-208ENST00000613122 FAM114A1Q8IWE2 563 aa23.22■■□□□ 1.31
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CTDP1-208ENST00000613122 GNAQP50148 359 aa23.22■■□□□ 1.31
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CTDP1-208ENST00000613122 PANK2Q9BZ23 570 aa23.21■■□□□ 1.31
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CTDP1-208ENST00000613122 TAF3Q5VWG9 929 aa23.2■■□□□ 1.3
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CTDP1-208ENST00000613122 CCDC174Q6PII3 467 aa23.19■■□□□ 1.3
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CTDP1-208ENST00000613122 MACROD2A1Z1Q3 448 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 MAP3K5Q99683 1374 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 NPATQ14207 1427 aa23.19■■□□□ 1.3
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CTDP1-208ENST00000613122 PPFIA3O75145 1194 aa23.19■■□□□ 1.3
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CTDP1-208ENST00000613122 ATP8B2P98198 1209 aa23.18■■□□□ 1.3
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CTDP1-208ENST00000613122 EXOC1Q9NV70 894 aa23.17■■□□□ 1.3
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CTDP1-208ENST00000613122 GNAT2P19087 354 aa23.16■■□□□ 1.3
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CTDP1-208ENST00000613122 STX1AQ16623 288 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.16■■□□□ 1.3
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CTDP1-208ENST00000613122 CCDC66A2RUB6 948 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 GBP3Q9H0R5 595 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 PTPN14Q15678 1187 aa23.16■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 DNA2P51530 1060 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 PLS1Q14651 629 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 NUCB1Q02818 461 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 ALG1Q9BT22 464 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 STK32BQ9NY57 414 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 NAPAP54920 295 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 RMND1Q9NWS8 449 aa23.15■■□□□ 1.3
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