RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608306.5

LINC00635-217, long intergenic non-protein coding RNA 635, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00635, Length 873 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00635-217ENST00000608306 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 ERBB4Q15303 1308 aa11.1□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 CHL1O00533 1208 aa11.1□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 PDIA6Q15084 440 aa11.1□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 CCDC93Q567U6 631 aa11.1□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 COPS6Q7L5N1 327 aa11.1□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa11.1□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 BCORQ6W2J9 1755 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 APAF1O14727 1248 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 ZNF34Q8IZ26 560 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 RTKN2Q8IZC4 609 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 C7orf43Q8WVR3 580 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 ZNF428Q96B54 188 aa11.09□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
LINC00635-217ENST00000608306 KDM3BQ7LBC6 1761 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 DDNO94850 711 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 HTRA3P83110 453 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 FSTL1Q12841 308 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 SBF1O95248 1867 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 DLEC1Q9Y238 1755 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 LTBP3Q9NS15 1303 aa11.08□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 ABCC12Q96J65 1359 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 PARP10Q53GL7 1025 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 SYNE4Q8N205 404 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 CFAP44Q96MT7 982 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 NLRP3Q96P20 1036 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 CHPF2Q9P2E5 772 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 SLX4Q8IY92 1834 aa11.07□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 LAMB4A4D0S4 1761 aa11.06□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 NTSR2O95665 410 aa11.06□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 CRY2Q49AN0 593 aa11.06□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 DUSP27Q5VZP5 1158 aa11.06□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 MBIPQ9NS73 344 aa11.06□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.06□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 POTECB2RU33 542 aa11.05□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 TCIRG1Q13488 830 aa11.05□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.05□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 IARSP41252 1262 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 CCDC184Q52MB2 194 aa11.04□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.04□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 NLRP10Q86W26 655 aa11.04□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.04□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 JDP2Q8WYK2 163 aa11.04□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 IQCA1LA6NCM1 817 aa11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 HOXB7P09629 217 aa11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 GNAI1P63096 354 aa11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 SLC51AQ86UW1 340 aa11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 HYPKQ9NX55 129 aa11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 ZNF541Q9H0D2 1346 aa11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 NUP98P52948 1817 aa11.02□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 CACNA1SQ13698 1873 aa11.02□□□□□ -0.64
LINC00635-217ENST00000608306 DOK7Q18PE1 504 aa11.02□□□□□ -0.65
LINC00635-217ENST00000608306 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
LINC00635-217ENST00000608306 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.02□□□□□ -0.65
LINC00635-217ENST00000608306 LARGE2Q8N3Y3 721 aa11.02□□□□□ -0.65
LINC00635-217ENST00000608306 PLBD2Q8NHP8 589 aa11.02□□□□□ -0.65
LINC00635-217ENST00000608306 PSMD1Q99460 953 aa11.02□□□□□ -0.65
LINC00635-217ENST00000608306 IFT57Q9NWB7 429 aa11.02□□□□□ -0.65
LINC00635-217ENST00000608306 GJA3Q9Y6H8 435 aa11.02□□□□□ -0.65
LINC00635-217ENST00000608306 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.02□□□□□ -0.65
LINC00635-217ENST00000608306 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa11.02□□□□□ -0.65
LINC00635-217ENST00000608306 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
LINC00635-217ENST00000608306 TIAM2Q8IVF5 1701 aa11.01□□□□□ -0.65
LINC00635-217ENST00000608306 C2orf72A6NCS6 295 aa11.01□□□□□ -0.65
LINC00635-217ENST00000608306 ANP32CO43423 234 aa11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms