RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FBXO3Q9UK99 471 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CPA1P15085 419 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANKRD1Q15327 319 aa22.29■■□□□ 1.16
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BCL9O00512 1426 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MBD3O95983 291 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GAS2L3Q86XJ1 694 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF445P59923 1031 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KRT32Q14532 448 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRRC24Q50LG9 513 aa22.27■■□□□ 1.16
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRP6O75581 1613 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TIMM10P62072 90 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PANK2Q9BZ23 570 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PALLDQ8WX93 1383 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GPT2Q8TD30 523 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF609O15014 1411 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.25■■□□□ 1.15
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.24■■□□□ 1.15
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ITGB4P16144 1822 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ME3Q16798 604 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GJB2P29033 226 aa22.21■■□□□ 1.15
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NLRP10Q86W26 655 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXC-AS2-202ENST00000604081 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEK1Q96PY6 1258 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 F13A1P00488 732 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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