RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589232.5

GTF3C2-AS1-206, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 254 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 VSIG10Q8N0Z9 540 aa5.57□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CARD14Q9BXL6 1004 aa5.57□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TLL2Q9Y6L7 1015 aa5.57□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SNED1Q8TER0 1413 aa5.57□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IQCA1LA6NCM1 817 aa5.56□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 AEBP1Q8IUX7 1158 aa5.56□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BEGAINQ9BUH8 593 aa5.56□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CARD11Q9BXL7 1154 aa5.56□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KDM3BQ7LBC6 1761 aa5.56□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WASHC2AQ641Q2 1341 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FZD9O00144 591 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SRGNP10124 158 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CANXP27824 592 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ECE1P42892 770 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SCNN1DP51172 638 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 WNT2BQ93097 391 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LGR6Q9HBX8 967 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 POLKQ9UBT6 870 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GJA3Q9Y6H8 435 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIF24Q5T7B8 1368 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MRC1P22897 1456 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SHTN1A0MZ66 631 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MAP2K2P36507 400 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SAPCD2Q86UD0 394 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SYNE4Q8N205 404 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BRIP1Q9BX63 1249 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SCN9AQ15858 1988 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CELF2O95319 508 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MTHFSP49914 203 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EIF5P55010 431 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 STYK1Q6J9G0 422 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HPS5Q9UPZ3 1129 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LAMB4A4D0S4 1761 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRPA1O75762 1119 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PDE6BP35913 854 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 IARSP41252 1262 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CCDC93Q567U6 631 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 GPC2Q8N158 579 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CNKSR1Q969H4 720 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MASTLQ96GX5 879 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF408Q9H9D4 720 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DLL1O00548 723 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CAMTA2O94983 1202 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRPM4Q8TD43 1214 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RNF186Q9NXI6 227 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PSME4Q14997 1843 aa5.51□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 COL4A1P02462 1669 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 FAM177BA6PVY3 158 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CA12O43570 354 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 A1BGP04217 495 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CNBD1Q8NA66 436 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 BCL11AQ9H165 835 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SLC52A2Q9HAB3 445 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DLG5Q8TDM6 1919 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ALPK3Q96L96 1907 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 LAMB1P07942 1786 aa5.5□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 RNMTO43148 476 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 KCNQ3O43525 872 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 EGFRP00533 1210 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 USP48Q86UV5 1035 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 CSRNP1Q96S65 589 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 PRKD2Q9BZL6 878 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 ABCC12Q96J65 1359 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 SZT2Q5T011 3432 aa5.49□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-206ENST00000589232 DUOX1Q9NRD9 1551 aa5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms