RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588707.5

GTF3C2-AS1-205, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 607 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ALDH1L1O75891 902 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NEXNQ0ZGT2 675 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CRY2Q49AN0 593 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PARP10Q53GL7 1025 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCDC93Q567U6 631 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TIAM2Q8IVF5 1701 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RIC1Q4ADV7 1423 aa9.14□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CACNA1SQ13698 1873 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 F6X3S4 739 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HMMRO75330 724 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TCIRG1Q13488 830 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RIC3Q7Z5B4 369 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GCC1Q96CN9 775 aa9.13□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 POTECB2RU33 542 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGHDP01880 384 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GNAI2P04899 355 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NLRP10Q86W26 655 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RTKN2Q8IZC4 609 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SYNE4Q8N205 404 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINS1Q8NG48 757 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NLRP3Q96P20 1036 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa9.12□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DDNO94850 711 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BEND3Q5T5X7 828 aa9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLC51AQ86UW1 340 aa9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.11□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SH3TC1Q8TE82 1336 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CEP350Q5VT06 3117 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FSTL1Q12841 308 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMC5Q8IY18 1101 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ANKRD44Q8N8A2 993 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MEIS3Q99687 375 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SNED1Q8TER0 1413 aa9.1□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 WDR90Q96KV7 1748 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IARSP41252 1262 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 APLP1P51693 650 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMC1BQ8NDV3 1235 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PSMD1Q99460 953 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 USP44Q9H0E7 712 aa9.09□□□□□ -0.95
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF541Q9H0D2 1346 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FZD9O00144 591 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CEP85Q6P2H3 762 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM89AQ96GI7 184 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C1orf115Q9H7X2 142 aa9.08□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GRM8O00222 908 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HTRA3P83110 453 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ATP8B2P98198 1209 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GRIPAP1Q4V328 841 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 JDP2Q8WYK2 163 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MYD88Q99836 296 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DCTPP1Q9H773 170 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COL4A5P29400 1685 aa9.07□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UTYO14607 1347 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IQCA1LA6NCM1 817 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BBOX1O75936 387 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 POTEIP0CG38 1075 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 POTEJP0CG39 1038 aa9.06□□□□□ -0.96
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 NUCB1Q02818 461 aa9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms