RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 TM4SF1P30408 202 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 CLCN6P51797 869 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 CNTROBQ8N137 903 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 TMOD3Q9NYL9 352 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 ASAP1Q9ULH1 1129 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 KIF20BQ96Q89 1820 aa7.29□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 DLL1O00548 723 aa7.28□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 AMPHP49418 695 aa7.28□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 KCNA1Q09470 495 aa7.28□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.28□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.28□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF428Q96B54 188 aa7.28□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 ATG3Q9NT62 314 aa7.28□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 TSKSQ9UJT2 592 aa7.28□□□□□ -1.24
TRIM25-208ENST00000574234 LILRB3O75022 631 aa7.27□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 BRD1O95696 1058 aa7.27□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 CYP4F22Q6NT55 531 aa7.27□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.27□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 A0A1W2PP64 1363 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 H0YIN7 160 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 CD46P15529 392 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 EPHX2P34913 555 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 GJA5P36382 358 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 USHBP1Q8N6Y0 703 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 SLC4A9Q96Q91 983 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 HACL1Q9UJ83 578 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 USTQ9Y2C2 406 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.26□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 SCN7AQ01118 1682 aa7.25□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 AP1G2O75843 785 aa7.25□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 FOSBP53539 338 aa7.25□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 QPCTQ16769 361 aa7.25□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.25□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.25□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.25□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.25□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 MOXD2PA6NHM9 499 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 AOC2O75106 756 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 PRSS12P56730 875 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 SOGA3Q5TF21 947 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 SPG7Q9UQ90 795 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 COL6A3P12111 3177 aa7.24□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 TONSLQ96HA7 1378 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 C21orf2O43822 256 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 GRM1Q13255 1194 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 CST9Q5W186 159 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 COG3Q96JB2 828 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa7.23□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 FLT4P35916 1363 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 CUL9Q8IWT3 2517 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 RCCD1A6NED2 376 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 ZPR1O75312 459 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 USP17L8P0C7I0 530 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 PHKG2P15735 406 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 NFIXQ14938 502 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.22□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 BRCA2P51587 3418 aa7.21□□□□□ -1.25
TRIM25-208ENST00000574234 ERVV-2B6SEH9 535 aa7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 E9PSI1 815 aa7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 SEC24BO95487 1268 aa7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 SERPINB2P05120 415 aa7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 NDUFV2P19404 249 aa7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 RFX1P22670 979 aa7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 PDE6BP35913 854 aa7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 NOGQ13253 232 aa7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 GPC2Q8N158 579 aa7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 ZDHHC16Q969W1 377 aa7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.21□□□□□ -1.26
TRIM25-208ENST00000574234 EYA1Q99502 592 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms