RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
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CCDC40-211ENST00000574099 MPNDQ8N594 471 aa23.14■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 CA12O43570 354 aa23.13■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 PROSER3Q2NL68 480 aa23.13■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.13■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 SLC10A5Q5PT55 438 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.12■■□□□ 1.29
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CCDC40-211ENST00000574099 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.12■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.11■■□□□ 1.29
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CCDC40-211ENST00000574099 PDIA6Q15084 440 aa23.11■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 SP8Q8IXZ3 490 aa23.11■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF428Q96B54 188 aa23.11■■□□□ 1.29
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CCDC40-211ENST00000574099 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.1■■□□□ 1.29
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CCDC40-211ENST00000574099 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 ZIC5Q96T25 663 aa23.1■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 YDJCA8MPS7 323 aa23.09■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 BBOX1O75936 387 aa23.09■■□□□ 1.29
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CCDC40-211ENST00000574099 NECTIN2Q92692 538 aa23.09■■□□□ 1.29
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CCDC40-211ENST00000574099 LRRC37AA6NMS7 1700 aa23.08■■□□□ 1.29
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CCDC40-211ENST00000574099 GRAPQ13588 217 aa23.08■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 USP48Q86UV5 1035 aa23.08■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 NLRP10Q86W26 655 aa23.08■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 MICALL2Q8IY33 904 aa23.08■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CCDC40-211ENST00000574099 H7C1D1 291 aa23.06■■□□□ 1.28
CCDC40-211ENST00000574099 NOGQ13253 232 aa23.06■■□□□ 1.28
CCDC40-211ENST00000574099 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CCDC40-211ENST00000574099 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCDC40-211ENST00000574099 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC40-211ENST00000574099 COPS6Q7L5N1 327 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC40-211ENST00000574099 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC40-211ENST00000574099 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.05■■□□□ 1.28
CCDC40-211ENST00000574099 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.04■■□□□ 1.28
CCDC40-211ENST00000574099 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.04■■□□□ 1.28
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CCDC40-211ENST00000574099 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CCDC40-211ENST00000574099 PSMD14O00487 310 aa23.02■■□□□ 1.28
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CCDC40-211ENST00000574099 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.02■■□□□ 1.28
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CCDC40-211ENST00000574099 COL4A1P02462 1669 aa23.02■■□□□ 1.28
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CCDC40-211ENST00000574099 RIMBP2O15034 1052 aa23.01■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 TCIRG1Q13488 830 aa23.01■■□□□ 1.27
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CCDC40-211ENST00000574099 WASHC4Q2M389 1173 aa23■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 RGMBQ6NW40 437 aa23■■□□□ 1.27
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CCDC40-211ENST00000574099 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
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CCDC40-211ENST00000574099 RIPK4P57078 832 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 TMC4Q7Z404 712 aa22.99■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 C6orf229H3BNL8 230 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 KRT24Q2M2I5 525 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 DPF2Q92785 391 aa22.98■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 SOX10P56693 466 aa22.97■■□□□ 1.27
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CCDC40-211ENST00000574099 DOK7Q18PE1 504 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.97■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 ECE2O60344 883 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 GPSM2P81274 684 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 POLLQ9UGP5 575 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 RTL9Q8NET4 1388 aa22.96■■□□□ 1.27
CCDC40-211ENST00000574099 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 FAM89AQ96GI7 184 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.95■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 SCN9AQ15858 1988 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 TRPA1O75762 1119 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.94■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 CCDC102AQ96A19 550 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 RNF186Q9NXI6 227 aa22.93■■□□□ 1.26
CCDC40-211ENST00000574099 GGA3Q9NZ52 723 aa22.93■■□□□ 1.26
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