RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	BBOX1	O75936	387 aa		15.02	■□□□□ -0
TCF4-238	ENST00000568169	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
TCF4-238	ENST00000568169	FAM161A	Q3B820	660 aa		15.02	■□□□□ -0
TCF4-238	ENST00000568169	SP8	Q8IXZ3	490 aa		15.02	■□□□□ -0
TCF4-238	ENST00000568169	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		15.02	■□□□□ -0
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	AOC2	O75106	756 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	RGS19	P49795	217 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		15.01	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	SLC34A2	O95436	690 aa		15	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		15	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	PROSER3	Q2NL68	480 aa		15	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	MPND	Q8N594	471 aa		15	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		15	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	TSKS	Q9UJT2	592 aa		15	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	CA12	O43570	354 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	ANXA1	P04083	346 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	TNIP1	Q15025	636 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	NLRP10	Q86W26	655 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		14.99	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	RAD17	O75943	681 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	14.98	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		14.98	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	YDJC	A8MPS7	323 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	GRAP	Q13588	217 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	COPS6	Q7L5N1	327 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		14.97	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	TCIRG1	Q13488	830 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	TMC4	Q7Z404	712 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		14.96	□□□□□ -0.01
TCF4-238	ENST00000568169	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	SHTN1	A0MZ66	631 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	SCN9A	Q15858	1988 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169		H7C1D1	291 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	RIPK4	P57078	832 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	NOG	Q13253	232 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	DPF2	Q92785	391 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	USP48	Q86UV5	1035 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	MICALL2	Q8IY33	904 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	NECTIN2	Q92692	538 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	ZIC5	Q96T25	663 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	PSME4	Q14997	1843 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	COL4A1	P02462	1669 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	PSMD14	O00487	310 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	HUNK	P57058	714 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	DGKZ	Q13574	1117 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	WASHC4	Q2M389	1173 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	DLK2	Q6UY11	383 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		14.91	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	CHL1	O00533	1208 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	KRT24	Q2M2I5	525 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		14.9	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
TCF4-238	ENST00000568169	EGFR	P00533	1210 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TCF4-238	ENST00000568169	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
TCF4-238	ENST00000568169	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
TCF4-238	ENST00000568169	RGMB	Q6NW40	437 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TCF4-238	ENST00000568169	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	14.89	□□□□□ -0.03
TCF4-238	ENST00000568169	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TCF4-238	ENST00000568169	POLL	Q9UGP5	575 aa		14.89	□□□□□ -0.03
TCF4-238	ENST00000568169	RIMBP2	O15034	1052 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TCF4-238	ENST00000568169	GPSM2	P81274	684 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TCF4-238	ENST00000568169	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF428	Q96B54	188 aa		14.88	□□□□□ -0.03
TCF4-238	ENST00000568169	FAM89A	Q96GI7	184 aa		14.88	□□□□□ -0.03

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