RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565975.5

SPNS1-207, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-207ENST00000565975 TSGA10IPQ3SY00 556 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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SPNS1-207ENST00000565975 SYT1P21579 422 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 RBSNQ9H1K0 784 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 SLAIN2Q9P270 581 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 SHANK3Q9BYB0 1731 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 ANKRD1Q15327 319 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 TICAM2Q86XR7 235 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 GPR108Q9NPR9 543 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 TJP1Q07157 1748 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 CCDC83Q8IWF9 413 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 HAUS7Q99871 368 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 ESPNB1AK53 854 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 F13A1P00488 732 aa26.71■■□□□ 1.87
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SPNS1-207ENST00000565975 USP48Q86UV5 1035 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS1-207ENST00000565975 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.71■■□□□ 1.87
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SPNS1-207ENST00000565975 TAF5LO75529 589 aa26.7■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
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SPNS1-207ENST00000565975 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 DBNDD2Q9BQY9 259 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 SYCE3A1L190 88 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 PHF14O94880 888 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 RPS6KB1P23443 525 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 KRT32Q14532 448 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 ME3Q16798 604 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 A1BGP04217 495 aa26.67■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 ST3GAL1Q11201 340 aa26.67■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 ATG3Q9NT62 314 aa26.67■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
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SPNS1-207ENST00000565975 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 TPCN1Q9ULQ1 816 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 MTMR6Q9Y217 621 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 KLHL34Q8N239 644 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF609O15014 1411 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 PALLDQ8WX93 1383 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 KBTBD3Q8NAB2 608 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 PDLIM2Q96JY6 352 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 GDPD2Q9HCC8 539 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS1-207ENST00000565975 CIAO1O76071 339 aa26.64■■□□□ 1.85
SPNS1-207ENST00000565975 HS1BP3Q53T59 392 aa26.64■■□□□ 1.85
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SPNS1-207ENST00000565975 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
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SPNS1-207ENST00000565975 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
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SPNS1-207ENST00000565975 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS1-207ENST00000565975 EYA2O00167 538 aa26.62■■□□□ 1.85
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SPNS1-207ENST00000565975 EVA1CP58658 441 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS1-207ENST00000565975 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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SPNS1-207ENST00000565975 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
SPNS1-207ENST00000565975 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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SPNS1-207ENST00000565975 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-207ENST00000565975 FBXO3Q9UK99 471 aa26.59■■□□□ 1.85
SPNS1-207ENST00000565975 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.59■■□□□ 1.85
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SPNS1-207ENST00000565975 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
SPNS1-207ENST00000565975 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SPNS1-207ENST00000565975 ZSCAN30Q86W11 494 aa26.57■■□□□ 1.84
SPNS1-207ENST00000565975 NEUROD6Q96NK8 337 aa26.57■■□□□ 1.84
SPNS1-207ENST00000565975 TCHHQ07283 1943 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS1-207ENST00000565975 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS1-207ENST00000565975 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-207ENST00000565975 DSCC1Q9BVC3 393 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS1-207ENST00000565975 FIBPO43427 364 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS1-207ENST00000565975 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SPNS1-207ENST00000565975 LRRC24Q50LG9 513 aa26.54■■□□□ 1.84
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