RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	BHMT	Q93088	406 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	CITED4	Q96RK1	184 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		7.4	□□□□□ -1.22
LINS1-210	ENST00000560934	EGFR	P00533	1210 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	VSIG8	P0DPA2	414 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	PDE3B	Q13370	1112 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	IRF7	Q92985	503 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	ASB16	Q96NS5	453 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	PNMA5	Q96PV4	448 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	FAM129B	Q96TA1	746 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	ELP3	Q9H9T3	547 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		7.39	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	GPR182	O15218	404 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	IGHA2	P01877	340 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	NFKB1	P19838	968 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	PLCB3	Q01970	1234 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	FAM182B	Q5T319	152 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	NLRP13	Q86W25	1043 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	ZFAT	Q9P243	1243 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	RARA	P10276	462 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	KRT76	Q01546	638 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	EHHADH	Q08426	723 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	LCE2C	Q5TA81	110 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	XKR5	Q6UX68	686 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	IGFLR1	Q9H665	355 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	MBIP	Q9NS73	344 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	WFS1	O76024	890 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	ORC1	Q13415	861 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	DSC3	Q14574	896 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	CNTN3	Q9P232	1028 aa		7.36	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	IGF1R	P08069	1367 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	TREH	O43280	583 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	MMP20	O60882	483 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	TNFRSF21	O75509	655 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	GMPR	P36959	345 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	SYT9	Q86SS6	491 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	RGS22	Q8NE09	1264 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	KLF15	Q9UIH9	416 aa		7.35	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	MAPK8	P45983	427 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		7.34	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
LINS1-210	ENST00000560934	NES	P48681	1621 aa		7.34	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	CFTR	P13569	1480 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	PHACTR2	O75167	634 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	MAP2K3	P46734	347 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	NEUROD1	Q13562	356 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	TREML4	Q6UXN2	200 aa		7.33	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	EREG	O14944	169 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	PSAP	P07602	524 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	CES1	P23141	567 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	EFCC1	Q9HA90	598 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	GGA1	Q9UJY5	639 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		7.32	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	MAP3K6	O95382	1288 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	ADAMTS2	O95450	1211 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	NEFL	P07196	543 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	ARAF	P10398	606 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	ERCC3	P19447	782 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	OR13H1	Q8NG92	308 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	CSRNP1	Q96S65	589 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	SETDB2	Q96T68	719 aa		7.31	□□□□□ -1.24
LINS1-210	ENST00000560934	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24

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