RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554184.5

CCNB1IP1-210, Transcript of cyclin B1 interacting protein 1, human

TSL 3

Gene CCNB1IP1, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		6.72	□□□□□ -1.33
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EPB42	P16452	691 aa		6.71	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CD33	P20138	364 aa		6.71	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CTBS	Q01459	385 aa		6.71	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	6.71	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		6.71	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MBIP	Q9NS73	344 aa		6.71	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		6.71	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C2CD2L	O14523	706 aa		6.7	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MX2	P20592	715 aa		6.7	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KRT76	Q01546	638 aa		6.7	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PDE3B	Q13370	1112 aa		6.7	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ORC1	Q13415	861 aa		6.7	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GRIN2C	Q14957	1233 aa		6.7	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	XP32	Q5T750	250 aa		6.7	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		6.7	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		6.7	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		6.7	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM161B	Q96MY7	647 aa		6.7	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		6.7	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GDF11	O95390	407 aa		6.69	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	6.69	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USP5	P45974	858 aa		6.69	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	COL19A1	Q14993	1142 aa		6.69	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GSX2	Q9BZM3	304 aa		6.69	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EGFR	P00533	1210 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PCSK2	P16519	638 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SPEM2	Q0P670	501 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TTC16	Q8NEE8	873 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC30A3	Q99726	388 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BMP4	P12644	408 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MAP2K3	P46734	347 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RASSF7	Q02833	373 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCIN	Q13939	588 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EFCC1	Q9HA90	598 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PARP2	Q9UGN5	583 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IGF1R	P08069	1367 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	XYLB	O75191	536 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CSRNP1	Q96S65	589 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLURP2	P0DP57	97 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TNFRSF21	O75509	655 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SASH3	O75995	380 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ADAMTS2	O95450	1211 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ARAF	P10398	606 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NEUROD1	Q13562	356 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	XKR5	Q6UX68	686 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ELP3	Q9H9T3	547 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CNTN3	Q9P232	1028 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZFAT	Q9P243	1243 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KLF15	Q9UIH9	416 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MAP3K6	O95382	1288 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NFKB1	P19838	968 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PI16	Q6UXB8	463 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SYT9	Q86SS6	491 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NLRP13	Q86W25	1043 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BHMT	Q93088	406 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PNMA5	Q96PV4	448 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BACH2	Q9BYV9	841 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SIN3B	O75182	1162 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ADH6	P28332	368 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	IRS1	P35568	1242 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ATP2B2	Q01814	1243 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ACD	Q96AP0	544 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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