RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	AMPD3	Q01432	767 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	LRRC41	Q15345	812 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	FCHSD2	O94868	740 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ATF3	P18847	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MAP2K2	P36507	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SNX21	Q969T3	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	INMT	O95050	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	GUCY2C	P25092	1073 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	HSD3B2	P26439	372 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	WTAP	Q15007	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CDKL5	O76039	1030 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	GOLGA2	Q08379	1002 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TRAF1	Q13077	416 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM110	Q86TL2	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TRIM52	Q96A61	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	BICD1	Q96G01	975 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TSKS	Q9UJT2	592 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	DBN1	Q16643	649 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM165	Q9HC07	324 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ATP6V1A	P38606	617 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CBX1	P83916	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SASH1	O94885	1247 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CSPG5	O95196	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	HSPA4	P34932	840 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	GJA8	P48165	433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	HSD17B7	P56937	341 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	PIP4K2B	P78356	416 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	DCLK2	Q8N568	766 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT2-231	ENST00000551483	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	RASA1	P20936	1047 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SCNN1A	P37088	669 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	GYS1	P13807	737 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNOT2-231	ENST00000551483	GNAT2	P19087	354 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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