RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549400.1

PTPRB-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRB, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-207ENST00000549400 VGLL3A8MV65 326 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRB-207ENST00000549400 RAI14Q9P0K7 980 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRB-207ENST00000549400 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRB-207ENST00000549400 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP4.78□□□□□ -1.64
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PTPRB-207ENST00000549400 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 RGPD1P0DJD0 1748 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 IL16Q14005 1332 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 GOLIM4O00461 696 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 FYB1O15117 783 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 MS4A1P11836 297 aa4.76□□□□□ -1.65
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