RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542953.1

NPIPB3-211, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B3, humanhuman

TSL 4

Gene NPIPB3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB3-211ENST00000542953 GRM1Q13255 1194 aa6.73□□□□□ -1.33
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NPIPB3-211ENST00000542953 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.68□□□□□ -1.34
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NPIPB3-211ENST00000542953 BRCA2P51587 3418 aa6.67□□□□□ -1.34
NPIPB3-211ENST00000542953 COL6A3P12111 3177 aa6.67□□□□□ -1.34
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NPIPB3-211ENST00000542953 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
NPIPB3-211ENST00000542953 RNF186Q9NXI6 227 aa6.66□□□□□ -1.34
NPIPB3-211ENST00000542953 GPRC5DQ9NZD1 345 aa6.66□□□□□ -1.34
NPIPB3-211ENST00000542953 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.66□□□□□ -1.34
NPIPB3-211ENST00000542953 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.66□□□□□ -1.34
NPIPB3-211ENST00000542953 CACNA1SQ13698 1873 aa6.66□□□□□ -1.34
NPIPB3-211ENST00000542953 TRPA1O75762 1119 aa6.65□□□□□ -1.34
NPIPB3-211ENST00000542953 PDE4AP27815 886 aa6.65□□□□□ -1.34
NPIPB3-211ENST00000542953 HUNKP57058 714 aa6.65□□□□□ -1.34
NPIPB3-211ENST00000542953 SLC39A6Q13433 755 aa6.65□□□□□ -1.34
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