RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 RGS12O14924 1447 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 PIK3R4Q99570 1358 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 CDKL5O76039 1030 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ABCD1P33897 745 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 LMNB2Q03252 620 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 MCM6Q14566 821 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC38Q502W7 563 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 IFNL1Q8IU54 200 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 LRRC8AQ8IWT6 810 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC150Q8NCX0 1101 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 DTNBP1Q96EV8 351 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 XAGE2Q96GT9 111 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 CRACR2AQ9BSW2 395 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 FUT8Q9BYC5 575 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ADGRB2O60241 1585 aa7.12□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 NOS1P29475 1434 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 MAP3K13O43283 966 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ERLIN1O75477 346 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 NEBLO76041 1014 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 TMF1P82094 1093 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 PSME1Q06323 249 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 APOBRQ0VD83 1088 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 SCRN1Q12765 414 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 HOOK2Q96ED9 719 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 OSBPL9Q96SU4 736 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 PDRG1Q9NUG6 133 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 CROCC2H7BZ55 1655 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 MRC2Q9UBG0 1479 aa7.11□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ABCC5O15440 1437 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 MSH6P52701 1360 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ERC2O15083 957 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 AHCYL1O43865 530 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ZEB2O60315 1214 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 SCP2P22307 547 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 SLC8A1P32418 973 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ARHGAP25P42331 645 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 HDXQ7Z353 690 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 MFN1Q8IWA4 741 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 TMTC2Q8N394 836 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 MPNDQ8N594 471 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 TESK2Q96S53 571 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 STK31Q9BXU1 1019 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 ODF2LQ9ULJ1 636 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.1□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 EBAG9O00559 213 aa7.09□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 FESP07332 822 aa7.09□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.275e-21■□□□□ 9.8
SNHG1-211ENST00000539921 IFFO1Q0D2I5 559 aa7.09□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 PKP1Q13835 747 aa7.09□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 DCTN1Q14203 1278 aa7.09□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 MYBPC2Q14324 1141 aa7.09□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 MAP3K11Q16584 847 aa7.09□□□□□ -1.27
SNHG1-211ENST00000539921 GORABQ5T7V8 394 aa7.09□□□□□ -1.27
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