RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534946.5

LMO3-211, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 1,016 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-211ENST00000534946 BCS1LQ9Y276 419 aa14.78□□□□□ -0.04
LMO3-211ENST00000534946 MS4A1P11836 297 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 TMC4Q7Z404 712 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.77□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 MYH3P11055 1940 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 RTL9Q8NET4 1388 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 H7C1W4 665 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 PLA2G12BQ9BX93 195 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.76□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 BCAR3O75815 825 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 TRIM27P14373 513 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 CTSWP56202 376 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa14.75□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 UTYO14607 1347 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 CAPN15O75808 1086 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 CACNA1SQ13698 1873 aa14.74□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 CASP7P55210 303 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 GRAPQ13588 217 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 CCDC93Q567U6 631 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 SYNE4Q8N205 404 aa14.73□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 BBOX1O75936 387 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.72□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 GNAI3P08754 354 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.71□□□□□ -0.05
LMO3-211ENST00000534946 SLX4Q8IY92 1834 aa14.71□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.7□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 C21orf2O43822 256 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.69□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 CHD4Q14839 1912 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 CSF1RP07333 972 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 SPOCK2Q92563 424 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 USP44Q9H0E7 712 aa14.68□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 RPS8P62241 208 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 SP8Q8IXZ3 490 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 SUCLG2Q96I99 432 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 PSMD1Q99460 953 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 GREM2Q9H772 168 aa14.67□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 SNED1Q8TER0 1413 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 ITGA6P23229 1130 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 FOXO4P98177 505 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 FAM161AQ3B820 660 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 CHMP3Q9Y3E7 222 aa14.66□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 LMNB1P20700 586 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 PDE3AQ14432 1141 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.65□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
LMO3-211ENST00000534946 NFKBIEO00221 500 aa14.64□□□□□ -0.07
LMO3-211ENST00000534946 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-211ENST00000534946 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LMO3-211ENST00000534946 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms