RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
TSTA3-215ENST00000532308 PDE6BP35913 854 aa25.46■■□□□ 1.67
TSTA3-215ENST00000532308 SPON1Q9HCB6 807 aa25.46■■□□□ 1.67
TSTA3-215ENST00000532308 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.46■■□□□ 1.67
TSTA3-215ENST00000532308 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.45■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.45■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.45■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 SSH3Q8TE77 659 aa25.45■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 POLA2Q14181 598 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.44■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 RTL9Q8NET4 1388 aa25.43■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.42■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 ITGA6P23229 1130 aa25.42■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 FAM161AQ3B820 660 aa25.42■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 C3orf67Q6ZVT6 689 aa25.42■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 GREM2Q9H772 168 aa25.42■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 C10orf71Q711Q0 1435 aa25.41■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 PTGER2P43116 358 aa25.41■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 KIF13BQ9NQT8 1826 aa25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 CRY2Q49AN0 593 aa25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
TSTA3-215ENST00000532308 IGHDP01880 384 aa25.38■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 COPRSQ9NQ92 184 aa25.38■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 H0YIN7 160 aa25.37■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.37■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 SRGNP10124 158 aa25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 NPR1P16066 1061 aa25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 C2CD5Q86YS7 1000 aa25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 GCC1Q96CN9 775 aa25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 MASTLQ96GX5 879 aa25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 DCTPP1Q9H773 170 aa25.36■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 FBXO3Q9UK99 471 aa25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 TAF1P21675 1872 aa25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 TGFB2P61812 414 aa25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.34■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 ALDH1B1P30837 517 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 GRAPQ13588 217 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 STYK1Q6J9G0 422 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.33■■□□□ 1.65
TSTA3-215ENST00000532308 SPEF2Q9C093 1822 aa25.33■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 RAB11FIP3O75154 756 aa25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 SIL1Q9H173 461 aa25.32■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 EYA2O00167 538 aa25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 CIAO1O76071 339 aa25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.643e-8■■■■□ 19.7
TSTA3-215ENST00000532308 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.31■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 BBOX1O75936 387 aa25.3■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.3■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 SMC5Q8IY18 1101 aa25.3■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 KLHL34Q8N239 644 aa25.3■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 CHRNA5P30532 468 aa25.29■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 CNKSR1Q969H4 720 aa25.29■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.29■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 TMC4Q7Z404 712 aa25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 LRP5O75197 1615 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 LRRC24Q50LG9 513 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 CACNA1SQ13698 1873 aa25.27■■□□□ 1.64
TSTA3-215ENST00000532308 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.26■■□□□ 1.63
TSTA3-215ENST00000532308 A0A0G2JLW4 131 aa25.26■■□□□ 1.63
TSTA3-215ENST00000532308 DPEP1P16444 411 aa25.26■■□□□ 1.63
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