RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 HYPKQ9NX55 129 aa12.01□□□□□ -0.49
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TRPS1-211ENST00000520276 ABCC6O95255 1503 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-211ENST00000520276 BRD1O95696 1058 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-211ENST00000520276 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-211ENST00000520276 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-211ENST00000520276 CHMP3Q9Y3E7 222 aa12.01□□□□□ -0.49
TRPS1-211ENST00000520276 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
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TRPS1-211ENST00000520276 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
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TRPS1-211ENST00000520276 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.98□□□□□ -0.49
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TRPS1-211ENST00000520276 MX1P20591 662 aa11.94□□□□□ -0.5
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TRPS1-211ENST00000520276 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.93□□□□□ -0.5
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TRPS1-211ENST00000520276 MYD88Q99836 296 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 RPS6KA4O75676 772 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa11.93□□□□□ -0.5
TRPS1-211ENST00000520276 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.93□□□□□ -0.5
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