RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 EREGO14944 169 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 EGFRP00533 1210 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 USP17L7P0C7H9 530 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 HS2ST1Q7LGA3 356 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 GALNT12Q8IXK2 581 aa11.93□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
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PGGT1B-205ENST00000514178 USP48Q86UV5 1035 aa11.92□□□□□ -0.5
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PGGT1B-205ENST00000514178 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa11.92□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 BRD7Q9NPI1 651 aa11.92□□□□□ -0.5
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF654Q8IZM8 581 aa11.91□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa11.91□□□□□ -0.5
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PGGT1B-205ENST00000514178 SAMD5Q5TGI4 173 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 NLRP8Q86W28 1048 aa11.9□□□□□ -0.5
PGGT1B-205ENST00000514178 PGBD3Q8N328 593 aa11.9□□□□□ -0.5
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PGGT1B-205ENST00000514178 F11P03951 625 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.89□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.89□□□□□ -0.51
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PGGT1B-205ENST00000514178 VEGFBP49765 207 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 GRM2Q14416 872 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa11.88□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM187AA6NFU0 413 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 AVPP01185 164 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 PMEPA1Q969W9 287 aa11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNQ4P56696 695 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 GMLQ99445 158 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 DNMT3LQ9UJW3 386 aa11.86□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFP42Q96MM3 310 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 KANSL3Q9P2N6 904 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 POTECB2RU33 542 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 SASH3O75995 380 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP2B1P20020 1258 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 EFHC2Q5JST6 749 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA0319Q5VV43 1072 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 ERMP1Q7Z2K6 904 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 LATS2Q9NRM7 1088 aa11.84□□□□□ -0.51
PGGT1B-205ENST00000514178 GSTT1P30711 240 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 KRT25Q7Z3Z0 450 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 GLIS3Q8NEA6 775 aa11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 A0A1W2PP55 124 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM157BP0CG42 384 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ARID5AQ03989 594 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 EHD4Q9H223 541 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 COPRSQ9NQ92 184 aa11.82□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 EFSO43281 561 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 EDN3P14138 238 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
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PGGT1B-205ENST00000514178 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
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PGGT1B-205ENST00000514178 C3orf58Q8NDZ4 430 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 OR13H1Q8NG92 308 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 GSX2Q9BZM3 304 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.81□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 MMP20O60882 483 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 THBS1P07996 1170 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 FIGNL1Q6PIW4 674 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 DPH6Q7L8W6 267 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 ARMC5Q96C12 935 aa11.8□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 PHF20L1A8MW92 1017 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 GJA8P48165 433 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 CTC1Q2NKJ3 1217 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP4R2Q9NY27 417 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.79□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 DCDC2BA2VCK2 349 aa11.78□□□□□ -0.52
PGGT1B-205ENST00000514178 RARAP10276 462 aa11.78□□□□□ -0.52
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