RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GPLD1P80108 840 aa9.04□□□□□ -0.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLAURQ03405 335 aa9.04□□□□□ -0.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C21orf2O43822 256 aa9.03□□□□□ -0.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MED26O95402 600 aa9.03□□□□□ -0.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RTN1Q16799 776 aa9.03□□□□□ -0.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.03□□□□□ -0.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WWC1Q8IX03 1113 aa9.03□□□□□ -0.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 STOML1Q9UBI4 398 aa9.03□□□□□ -0.96
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TGFB1P01137 390 aa9.02□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GRIK1P39086 918 aa9.02□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.02□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C11orf16Q9NQ32 467 aa9.02□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZFATQ9P243 1243 aa9.02□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RARAP10276 462 aa9.01□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.01□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OGFOD1Q8N543 542 aa9.01□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GLB1P16278 677 aa9□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 Q6ZS46 218 aa9□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SIX5Q8N196 739 aa9□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP17L3A6NCW0 530 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP17L4A6NCW7 530 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.99□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 INPP5BP32019 993 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NRLP54845 237 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IFT43Q96FT9 208 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BCS1LQ9Y276 419 aa8.98□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IDH3AP50213 366 aa8.97□□□□□ -0.97
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SASH3O75995 380 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARSDP51689 593 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.96□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.96□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WNT11O96014 354 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPINK2P20155 84 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NFIAQ12857 509 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MCM6Q14566 821 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PLD4Q96BZ4 506 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 COG6Q9Y2V7 657 aa8.95□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CEP41Q9BYV8 373 aa8.94□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RBSNQ9H1K0 784 aa8.94□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GHRHP01286 108 aa8.93□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SETDB1Q15047 1291 aa8.93□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DTX1Q86Y01 620 aa8.93□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MUC3BQ9H195 1237 aa8.93□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.92□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ADAMTS4O75173 837 aa8.92□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SEC13P55735 322 aa8.92□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SIK1P57059 783 aa8.92□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UVSSAQ2YD98 709 aa8.92□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.92□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATP9BO43861 1147 aa8.91□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DKK1O94907 266 aa8.91□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PSAPP07602 524 aa8.91□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KLK14Q9P0G3 267 aa8.91□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 J3QW42 95 aa8.9□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RASA1P20936 1047 aa8.9□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RNF43Q68DV7 783 aa8.9□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DBNDD2Q9BQY9 259 aa8.9□□□□□ -0.98
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MICAL2O94851 1124 aa8.89□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.89□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HINFPQ9BQA5 517 aa8.89□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.89□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPME1Q9Y570 386 aa8.89□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DGKZQ13574 1117 aa8.88□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.88□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.88□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PRR19A6NJB7 356 aa8.87□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 EGFRP00533 1210 aa8.87□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IGFBP4P22692 258 aa8.87□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 XYLBO75191 536 aa8.86□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 JAG1P78504 1218 aa8.86□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.86□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HMX2A2RU54 273 aa8.85□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SOX18P35713 384 aa8.85□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ACAD11Q709F0 780 aa8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms