RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
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PGGT1B-204ENST00000503638 C3orf67Q6ZVT6 689 aa16.86■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 BCS1LQ9Y276 419 aa16.86■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.86■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.86■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.85■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 H7C1W4 665 aa16.85■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 PDE8AO60658 829 aa16.85■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 SRGNP10124 158 aa16.85■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 NPR1P16066 1061 aa16.85■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC10A5Q5PT55 438 aa16.85■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM57Q8N5G2 664 aa16.85■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 PANK1Q8TE04 598 aa16.85■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 MASTLQ96GX5 879 aa16.85■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 CDHR2Q9BYE9 1310 aa16.85■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
PGGT1B-204ENST00000503638 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
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PGGT1B-204ENST00000503638 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 CTSWP56202 376 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 RIC1Q4ADV7 1423 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC152Q4G0S7 254 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 STYK1Q6J9G0 422 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 TTLL6Q8N841 843 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 CNKSR1Q969H4 720 aa16.83■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNA3P22001 575 aa16.82■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 RLBP1P12271 317 aa16.81■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 ALDH1B1P30837 517 aa16.81■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 RRP1P56182 461 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 CRY2Q49AN0 593 aa16.81■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa16.81■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa16.81■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 USP44Q9H0E7 712 aa16.81■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 HDAC5Q9UQL6 1122 aa16.81■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.81■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 LAMB2P55268 1798 aa16.8■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 GNAI3P08754 354 aa16.8■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 CASP7P55210 303 aa16.8■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 SUCLG2Q96I99 432 aa16.8■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 MEIS3Q99687 375 aa16.8■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 NMRK2Q9NPI5 230 aa16.8■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 COG6Q9Y2V7 657 aa16.8■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 TAF7LQ5H9L4 462 aa16.79■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 C21orf2O43822 256 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 TOMM70O94826 608 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM161AQ3B820 660 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 TTLL11Q8NHH1 800 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 CRAMP1Q96RY5 1269 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 GREM2Q9H772 168 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 CACNA1SQ13698 1873 aa16.78■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 UTYO14607 1347 aa16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 GRAPQ13588 217 aa16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 PDE3AQ14432 1141 aa16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 MVPQ14764 893 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 PLA2G12BQ9BX93 195 aa16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 SEC31BQ9NQW1 1179 aa16.77■□□□□ 0.28
PGGT1B-204ENST00000503638 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
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PGGT1B-204ENST00000503638 GNAI2P04899 355 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 FOXO4P98177 505 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.76■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 ITGA6P23229 1130 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 APLP1P51693 650 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 C9orf131Q5VYM1 1079 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.75■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 MYH3P11055 1940 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 BBOX1O75936 387 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 RPS8P62241 208 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 SOGA3Q5TF21 947 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 MPHOSPH8Q99549 860 aa16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 HTRA3P83110 453 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC93Q567U6 631 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 OLFM4Q6UX06 510 aa16.73■□□□□ 0.27
PGGT1B-204ENST00000503638 KAZALD1Q96I82 304 aa16.73■□□□□ 0.27
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