RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492702.1

BABAM2-208, Transcript of BRISC and BRCA1 A complex member 2, human

TSL 2

Gene BABAM2, Length 616 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BABAM2-208	ENST00000492702	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	LAMA3	Q16787	3333 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	INHBE	P58166	350 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	DPF2	Q92785	391 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	CDCA5	Q96FF9	252 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	STAP2	Q9UGK3	403 aa		11.72	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	FYB1	O15117	783 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	EVI5	O60447	810 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	RAD17	O75943	681 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		11.71	□□□□□ -0.53
BABAM2-208	ENST00000492702	BMP8B	P34820	402 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		11.7	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	ZNF609	O15014	1411 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		11.69	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	SP3	Q02447	781 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	GGA3	Q9NZ52	723 aa		11.68	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	CAMTA2	O94983	1202 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		11.67	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	NF2	P35240	595 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	BCAM	P50895	628 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.66	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	SLC39A6	Q13433	755 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	IFNL1	Q8IU54	200 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	TDH	Q8IZJ6	230 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		11.65	□□□□□ -0.54
BABAM2-208	ENST00000492702	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	GDF15	Q99988	308 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	MOB2	Q70IA6	237 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	GUCD1	Q96NT3	240 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	NYX	Q9GZU5	481 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	EGFR	P00533	1210 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	GJA8	P48165	433 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	SPRYD7	Q5W111	196 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.61	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	CRHR2	Q13324	411 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		11.6	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	MUC3A	Q02505	3323 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	PSMD14	O00487	310 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	SLC24A1	O60721	1099 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	CAPN2	P17655	700 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	KIF22	Q14807	665 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	FAM161B	Q96MY7	647 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		11.59	□□□□□ -0.55
BABAM2-208	ENST00000492702	CACNA1A	O00555	2505 aa		11.58	□□□□□ -0.56
BABAM2-208	ENST00000492702	POTEB2	H3BUK9	544 aa		11.58	□□□□□ -0.56
BABAM2-208	ENST00000492702	RGL2	O15211	777 aa		11.58	□□□□□ -0.56
BABAM2-208	ENST00000492702	GJB1	P08034	283 aa		11.58	□□□□□ -0.56

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