RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490669.1

JMJD1C-208, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene JMJD1C, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-208ENST00000490669 ERVK-9P63128 1117 aa8.67□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 ITSN1Q15811 1721 aa8.67□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 RNF20Q5VTR2 975 aa8.67□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.67□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 NWD2Q9ULI1 1742 aa8.66□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A1W2PRU2 124 aa8.66□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 ARHGEF15O94989 841 aa8.66□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 GPC1P35052 558 aa8.66□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 ORAI2Q96SN7 254 aa8.66□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.66□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 GLI3P10071 1580 aa8.65□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 RGS12O14924 1447 aa8.65□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 NR1H3Q13133 447 aa8.65□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 GAS6Q14393 721 aa8.65□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.65□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.65□□□□□ -1.02
JMJD1C-208ENST00000490669 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF592Q92610 1267 aa8.64□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 GMCL1Q96IK5 515 aa8.64□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 NLRP3Q96P20 1036 aa8.64□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 BRD2P25440 801 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 SCTRP47872 440 aa8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM132EQ6IEE7 984 aa8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 TRIM22Q8IYM9 498 aa8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 EP400Q96L91 3159 aa8.63□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.62□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 IRS1P35568 1242 aa8.62□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 MAP3K10Q02779 954 aa8.62□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 CLN3Q13286 438 aa8.62□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 RGL3Q3MIN7 710 aa8.62□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 BANK1Q8NDB2 785 aa8.62□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.62□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 TULP4Q9NRJ4 1543 aa8.62□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.62□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 ATRNO75882 1429 aa8.62□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 AFF2P51816 1311 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 SLIT2O94813 1529 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 GPR25O00155 361 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 GPR37L1O60883 481 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 POU4F2Q12837 409 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 DBN1Q16643 649 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 FOXR1Q6PIV2 292 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 SIRT1Q96EB6 747 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 MBIPQ9NS73 344 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 ATP7BP35670 1465 aa8.61□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 QRICH2Q9H0J4 1663 aa8.6□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 GRIP2Q9C0E4 1043 aa8.6□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.6□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.6□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 ANKARQ7Z5J8 1434 aa8.6□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 H7C1W4 665 aa8.59□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 TRAK2O60296 914 aa8.59□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 NBPF15Q8N660 670 aa8.59□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 TNS3Q68CZ2 1445 aa8.59□□□□□ -1.03
JMJD1C-208ENST00000490669 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.58□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 KANK3Q6NY19 840 aa8.58□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 ENAMQ9NRM1 1142 aa8.58□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 STK26Q9P289 416 aa8.58□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa8.57□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 NPHP3Q7Z494 1330 aa8.57□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.57□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.57□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 APBB1O00213 710 aa8.57□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.57□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 AKAP12Q02952 1782 aa8.57□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 NRKQ7Z2Y5 1582 aa8.56□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 LMO7Q8WWI1 1683 aa8.56□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.56□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 WDR44Q5JSH3 913 aa8.56□□□□□ -1.04
JMJD1C-208ENST00000490669 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms