RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490163.5

UBXN4-208, Transcript of UBX domain protein 4, human

TSL 2

Gene UBXN4, Length 3,394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN4-208	ENST00000490163	EMP3	P54852	163 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	TBX4	P57082	545 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	LONRF3	Q496Y0	759 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	ZPR1	O75312	459 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
UBXN4-208	ENST00000490163		A0A087X0B3	334 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	RFPL1	O75677	317 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	RLBP1	P12271	317 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ETFB	P38117	255 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ATP2B2	Q01814	1243 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ZBTB33	Q86T24	672 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.21	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	NPTXR	O95502	500 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ITPKA	P23677	461 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	SKOR1	P84550	965 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	PWP1	Q13610	501 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	IFFO2	Q5TF58	517 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	RNF180	Q86T96	592 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	NBPF3	Q9H094	633 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	COPRS	Q9NQ92	184 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	TNFRSF21	O75509	655 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	PMEPA1	Q969W9	287 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	HTR3A	P46098	478 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	NBPF15	Q8N660	670 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	FEZ1	Q99689	392 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	GINM1	Q9NU53	330 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	MORC3	Q14149	939 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	DDR2	Q16832	855 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	APPBP2	Q92624	585 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	FAM205C	A6NFA0	338 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	EVA1C	P58658	441 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	GRM2	Q14416	872 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	EDEM1	Q92611	657 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	TCF12	Q99081	682 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.18	□□□□□ -1.74
UBXN4-208	ENST00000490163	GYS2	P54840	703 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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