RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 EPB42P16452 691 aa8.54□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 GTF2IP78347 998 aa8.54□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPLD1P80108 840 aa8.54□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLAURQ03405 335 aa8.54□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.54□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.54□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 TNS4Q8IZW8 715 aa8.54□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.54□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 ITGB5P18084 799 aa8.53□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 IER5Q5VY09 327 aa8.53□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.53□□□□□ -1.04
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBXL18Q96ME1 805 aa8.52□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 C11orf16Q9NQ32 467 aa8.52□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.51□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 HMX2A2RU54 273 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 MUC3BQ9H195 1237 aa8.5□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 SOX11P35716 441 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 SETDB1Q15047 1291 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYRFLQ96LU7 910 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNRKQ9NRH2 765 aa8.49□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 NRLP54845 237 aa8.48□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 SEMA3FQ13275 785 aa8.48□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.48□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.48□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 IRF5Q13568 498 aa8.47□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.47□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.47□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.47□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 PIM2Q9P1W9 311 aa8.47□□□□□ -1.05
CACNA2D1-211ENST00000486539 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.46□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.45□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRNPP04156 253 aa8.45□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 VAC14Q08AM6 782 aa8.45□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.45□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZFATQ9P243 1243 aa8.45□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.45□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.44□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 RARAP10276 462 aa8.44□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 PKN1Q16512 942 aa8.44□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 WASHC4Q2M389 1173 aa8.44□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.44□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLD4Q96BZ4 506 aa8.44□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACAD11Q709F0 780 aa8.43□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.43□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.43□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBSNQ9H1K0 784 aa8.43□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 WDR64B1ANS9 1081 aa8.42□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0R2N6 131 aa8.42□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa8.42□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM50Q86XT4 487 aa8.42□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 MSMPQ1L6U9 139 aa8.41□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 BEND4Q6ZU67 534 aa8.41□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa8.41□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.41□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.41□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.41□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 GHRHP01286 108 aa8.4□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.4□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRT25Q7Z3Z0 450 aa8.4□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFT43Q96FT9 208 aa8.4□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.4□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATG3Q9NT62 314 aa8.4□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPME1Q9Y570 386 aa8.4□□□□□ -1.06
CACNA2D1-211ENST00000486539 SKIP12755 728 aa8.39□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 FOSL1P15407 271 aa8.39□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 NCOA4Q13772 614 aa8.38□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF124Q15973 351 aa8.38□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 RTN1Q16799 776 aa8.38□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.38□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.38□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.37□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 WISP1O95388 367 aa8.37□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 BMP3P12645 472 aa8.37□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 INPP5BP32019 993 aa8.37□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP1A2P50993 1020 aa8.37□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 SIK1P57059 783 aa8.37□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CACNA2D1-211ENST00000486539 PIK3CDO00329 1044 aa8.36□□□□□ -1.07
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