RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486192.1

SORCS1-208, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, human

TSL 2

Gene SORCS1, Length 632 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SORCS1-208	ENST00000486192	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	KCNA3	P22001	575 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	FSTL1	Q12841	308 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	ERFE	Q4G0M1	354 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	FAM89A	Q96GI7	184 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	NLRP3	Q96P20	1036 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	FAM177B	A6PVY3	158 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	PDE8A	O60658	829 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	CHRNA5	P30532	468 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	CASP7	P55210	303 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	USP44	Q9H0E7	712 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	ABCC12	Q96J65	1359 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192		H0YIN7	160 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	AAMP	Q13685	434 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	PIM2	Q9P1W9	311 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	PLIN1	O60240	522 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	SRGN	P10124	158 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	RLBP1	P12271	317 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	NPR1	P16066	1061 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	CTSW	P56202	376 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	RASSF7	Q02833	373 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	STYK1	Q6J9G0	422 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	MASTL	Q96GX5	879 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	PANK1	Q8TE04	598 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SORCS1-208	ENST00000486192	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	GNAI2	P04899	355 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	CSF1R	P07333	972 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	MEIS3	Q99687	375 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	RNF39	Q9H2S5	420 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	TNN	Q9UQP3	1299 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	LAMB2	P55268	1798 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	COG6	Q9Y2V7	657 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	BBOX1	O75936	387 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	FOXO4	P98177	505 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	MTX1	Q13505	466 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	SOGA3	Q5TF21	947 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	GRAP	Q13588	217 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	ITGA6	P23229	1130 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		11.16	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
SORCS1-208	ENST00000486192	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62

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