RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484396.1

ACSS1-204, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACSS1, Length 4,767 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS1-204ENST00000484396 SAAL1Q96ER3 474 aa14.63□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 VCXQ9H320 206 aa14.63□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.63□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.63□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 MAPKBP1O60336 1514 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 LIG3P49916 1009 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 NEK4P51957 841 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 NEO1Q92859 1461 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 KIF5CO60282 957 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 ZNF365Q70YC5 407 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 CTAGE5O15320 804 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 OPA1O60313 960 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 TRAF1Q13077 416 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 ATP2B1P20020 1258 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 CCDC186Q7Z3E2 898 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 GOLGA1Q92805 767 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 SNX21Q969T3 373 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 CEP89Q96ST8 783 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 FSD1Q9BTV5 496 aa14.62□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 PTPRKQ15262 1439 aa14.61□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 SERPINC1P01008 464 aa14.61□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 ACTN2P35609 894 aa14.61□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.61□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 DAAM2Q86T65 1068 aa14.61□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 NSD2O96028 1365 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 TXLNAP40222 546 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 AFAP1L1Q8TED9 768 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 CABS1Q96KC9 395 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 RWDD2BP57060 319 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 TRIM29Q14134 588 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 PAF1Q8N7H5 531 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 SMC5Q8IY18 1101 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 TRIM4Q9C037 500 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.59□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.59□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.59□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.59□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 SIL1Q9H173 461 aa14.59□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.59□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.59□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 MED4Q9NPJ6 270 aa14.59□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 SKILP12757 684 aa14.58□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 PPFIBP1Q86W92 1011 aa14.58□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 HYPKQ9NX55 129 aa14.58□□□□□ -0.07
ACSS1-204ENST00000484396 CNTROBQ8N137 903 aa14.58□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 SRGAP3O43295 1099 aa14.58□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 PFDN1O60925 122 aa14.58□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 CAPN7Q9Y6W3 813 aa14.58□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.58□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 DDB1Q16531 1140 aa14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 EXOC4Q96A65 974 aa14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 PPFIA3O75145 1194 aa14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 DESP17661 470 aa14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 WDR78Q5VTH9 848 aa14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 RNF217Q8TC41 542 aa14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.57□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 SESN3P58005 492 aa14.56□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 CCDC40Q4G0X9 1142 aa14.56□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 KDM4AO75164 1064 aa14.56□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 GYS2P54840 703 aa14.56□□□□□ -0.08
ACSS1-204ENST00000484396 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms