RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 H7C1D1 291 aa9.74□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 SUSD4Q5VX71 490 aa9.74□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 RASAL3Q86YV0 1011 aa9.74□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 SUPT20HQ8NEM7 779 aa9.74□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 DPF2Q92785 391 aa9.74□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa9.73□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 CEP290O15078 2479 aa9.73□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 NTSR2O95665 410 aa9.73□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 COL6A3P12111 3177 aa9.73□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.73□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 TBC1D8O95759 1140 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 SP8Q8IXZ3 490 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 HDAC9Q9UKV0 1011 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 ABCC4O15439 1325 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa9.72□□□□□ -0.85
CASQ1-203ENST00000481081 POTEFA5A3E0 1075 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 GPR25O00155 361 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 PSMD14O00487 310 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 GPTP24298 496 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 MPNDQ8N594 471 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 DUOX1Q9NRD9 1551 aa9.71□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 BBOX1O75936 387 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 TM4SF4P48230 202 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 CDCA5Q96FF9 252 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 NLRP3Q96P20 1036 aa9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 NGEFQ8N5V2 710 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 CFHR5Q9BXR6 569 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 LAMB4A4D0S4 1761 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 RTL9Q8NET4 1388 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 DLL1O00548 723 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 RPS12P25398 132 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 FKBP1BP68106 108 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 MCM10Q7L590 875 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 KCNQ5Q9NR82 932 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 GGA3Q9NZ52 723 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 LAMB2P55268 1798 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa9.68□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 FKTNO75072 461 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 MOB2Q70IA6 237 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 SULF1Q8IWU6 871 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 RSPH6AQ9H0K4 717 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 DBNDD1Q9H9R9 158 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 TAF1P21675 1872 aa9.67□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 LRRC37AA6NMS7 1700 aa9.66□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 PRKAR2BP31323 418 aa9.66□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 GRAPQ13588 217 aa9.66□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 DCTN1Q14203 1278 aa9.66□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 PARP10Q53GL7 1025 aa9.66□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 KIF6Q6ZMV9 814 aa9.66□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 SCN9AQ15858 1988 aa9.66□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 LAMA3Q16787 3333 aa9.65□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 VIL1P09327 827 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 EN2P19622 333 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 WASHC4Q2M389 1173 aa9.65□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 LRP10Q7Z4F1 713 aa9.65□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 OTUD5Q96G74 571 aa9.65□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 MIS18AQ9NYP9 233 aa9.65□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
CASQ1-203ENST00000481081 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.64□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 MYL6BP14649 208 aa9.64□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 SCARF1Q14162 830 aa9.64□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 OTOP1Q7RTM1 612 aa9.64□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 POLLQ9UGP5 575 aa9.64□□□□□ -0.87
CASQ1-203ENST00000481081 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms