RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478988.2

PDZRN3-AS1-201, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 961 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.98□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COL4A1P02462 1669 aa6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NTSR2O95665 410 aa6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ALDH1B1P30837 517 aa6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RIPK4P57078 832 aa6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PDIA6Q15084 440 aa6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IFNL1Q8IU54 200 aa6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PSMD1Q99460 953 aa6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.97□□□□□ -1.29
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LAMB1P07942 1786 aa6.96□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.96□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POTEJP0CG39 1038 aa6.96□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MYL6BP14649 208 aa6.96□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GSE1Q14687 1217 aa6.96□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PARP10Q53GL7 1025 aa6.96□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IFFO2Q5TF58 517 aa6.96□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.96□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.96□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.96□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POTEFA5A3E0 1075 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FZD9O00144 591 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHL1O00533 1208 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HOXB7P09629 217 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PROSER3Q2NL68 480 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SUSD4Q5VX71 490 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RUNDC1Q96C34 613 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PASKQ96RG2 1323 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.95□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PYGBP11216 843 aa6.94□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GPTP24298 496 aa6.94□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HTRA3P83110 453 aa6.94□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa6.94□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 OLFM4Q6UX06 510 aa6.94□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM9BQ8IZU0 186 aa6.94□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GPC2Q8N158 579 aa6.94□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM177BA6PVY3 158 aa6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NBR1Q14596 966 aa6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NLRP10Q86W26 655 aa6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LDHDQ86WU2 507 aa6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NGEFQ8N5V2 710 aa6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 VPS33BQ9H267 617 aa6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCC4O15439 1325 aa6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MYH13Q9UKX3 1938 aa6.93□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ANXA1P04083 346 aa6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF853P0CG23 659 aa6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TCIRG1Q13488 830 aa6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COPS6Q7L5N1 327 aa6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SYNE4Q8N205 404 aa6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 JDP2Q8WYK2 163 aa6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NLRP3Q96P20 1036 aa6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHPF2Q9P2E5 772 aa6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HACL1Q9UJ83 578 aa6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ADAMTS8Q9UP79 889 aa6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.92□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EPHX2P34913 555 aa6.91□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KRT24Q2M2I5 525 aa6.91□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CCDC184Q52MB2 194 aa6.91□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.91□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMC4Q7Z404 712 aa6.91□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PLBD2Q8NHP8 589 aa6.91□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.91□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CDHR2Q9BYE9 1310 aa6.91□□□□□ -1.3
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CNTNAP1P78357 1384 aa6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms