RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM94Q12767 1356 aa21.83■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 ABCC6O95255 1503 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 TCEANC2Q96MN5 208 aa21.82■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 KRT32Q14532 448 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 TAF5LO75529 589 aa21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 COL15A1P39059 1388 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 TPM2P07951 284 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 JCADQ9P266 1359 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.8■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 KRT85P78386 507 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 DCCP43146 1447 aa21.79■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 COL18A1P39060 1754 aa21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 CADPS2Q86UW7 1296 aa21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 KLHL34Q8N239 644 aa21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 DBNDD2Q9BQY9 259 aa21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.78■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 STK3Q13188 491 aa21.77■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 FERMT3Q86UX7 667 aa21.77■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 USP25Q9UHP3 1055 aa21.77■■□□□ 1.08
SYNE4-204ENST00000465425 HAUS7Q99871 368 aa21.77■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.76■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.76■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 NEK1Q96PY6 1258 aa21.76■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.75■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 CASP7P55210 303 aa21.75■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.75■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF609O15014 1411 aa21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.74■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 CPDO75976 1380 aa21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 TTC6Q86TZ1 520 aa21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 ELP1O95163 1332 aa21.73■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 ADCY5O95622 1261 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 TERF1P54274 439 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 H7C1W4 665 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 FGD1P98174 961 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.72■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 NBPF26B4DH59 902 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC192P0DO97 292 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 FOXO4P98177 505 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 NBPF14Q5TI25 921 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 NBPF15Q8N660 670 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 GTF3C6Q969F1 213 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 CHGBP05060 677 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 CYP21A2P08686 494 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 PLCB2Q00722 1185 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 Q6ZUG5 572 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 SPATA32Q96LK8 384 aa21.71■■□□□ 1.07
SYNE4-204ENST00000465425 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.7■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 KDM4AO75164 1064 aa21.7■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa21.7■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.69■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.69■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.69■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 GOLIM4O00461 696 aa21.69■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.69■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 RRP9O43818 475 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.68■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 PRDM11Q9NQV5 511 aa21.68■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.68■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 GPR108Q9NPR9 543 aa21.68■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 PALLDQ8WX93 1383 aa21.67■■□□□ 1.06
SYNE4-204ENST00000465425 ERVV-2B6SEH9 535 aa21.67■■□□□ 1.06
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