RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPON1	Q9HCB6	807 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		11.7	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	POLA2	Q14181	598 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	SSH3	Q8TE77	659 aa		11.69	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	ITGA6	P23229	1130 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		11.68	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	FAM161A	Q3B820	660 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	CRY2	Q49AN0	593 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	GREM2	Q9H772	168 aa		11.67	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602		H0YIN7	160 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	PTGER2	P43116	358 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	GCC1	Q96CN9	775 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	DCTPP1	Q9H773	170 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	COPRS	Q9NQ92	184 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	FBXO3	Q9UK99	471 aa		11.66	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	IGHD	P01880	384 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	SRGN	P10124	158 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	NPR1	P16066	1061 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	ALDH1B1	P30837	517 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	MASTL	Q96GX5	879 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		11.65	□□□□□ -0.54
SH3BP4-208	ENST00000462602	LAMB2	P55268	1798 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	CIAO1	O76071	339 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	TGFB2	P61812	414 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	GRAP	Q13588	217 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	STYK1	Q6J9G0	422 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	MYH3	P11055	1940 aa		11.64	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	EYA2	O00167	538 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	BBOX1	O75936	387 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMC4	Q7Z404	712 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	SMC5	Q8IY18	1101 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		11.63	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	SIL1	Q9H173	461 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		11.62	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.61	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	DPEP1	P16444	411 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	CHRNA5	P30532	468 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		11.6	□□□□□ -0.55
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		11.59	□□□□□ -0.55

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