RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 SPEM2Q0P670 501 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 A6NHS1 94 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 POTECB2RU33 542 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 PHACTR2O75167 634 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 STRN4Q9NRL3 753 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-205ENST00000462042 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP3K6O95382 1288 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 CD33P20138 364 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 E9PSI1 815 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 SASH3O75995 380 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 RARAP10276 462 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 ORC1Q13415 861 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 FRMD6Q96NE9 622 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 SOX18P35713 384 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF787Q6DD87 383 aa9.37□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BM21 787 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR25O00155 361 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 TARSP26639 723 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 KRT25Q7Z3Z0 450 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 OR13H1Q8NG92 308 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.36□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 PSAPP07602 524 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 BMP4P12644 408 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 NFKB1P19838 968 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 MX2P20592 715 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 CES1P23141 567 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 CTBSQ01459 385 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 PCSK7Q16549 785 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 BHMTQ93088 406 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC30A3Q99726 388 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 MMP20O60882 483 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 VSIG8P0DPA2 414 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 HCN2Q9UL51 889 aa9.34□□□□□ -0.91
RABGGTB-205ENST00000462042 GIPC1O14908 333 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 VAMP1P23763 118 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 MAP2K3P46734 347 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 PLAURQ03405 335 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 CHRDQ9H2X0 955 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 CNTN3Q9P232 1028 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFATQ9P243 1243 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 SPG7Q9UQ90 795 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 SIN3BO75182 1162 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 EDN3P14138 238 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 NRLP54845 237 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF428Q96B54 188 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 MBIPQ9NS73 344 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 PARP2Q9UGN5 583 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 EREGO14944 169 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 GNA15P30679 374 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 HYAL2Q12891 473 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 GRIN2CQ14957 1233 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 TMC4Q7Z404 712 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 MRS2Q9HD23 443 aa9.31□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 UNCXA6NJT0 531 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ARAFP10398 606 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 VEGFBP49765 207 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 DAB2P98082 770 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 PSMD2Q13200 908 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 SYT9Q86SS6 491 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 IRF7Q92985 503 aa9.3□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 KIF4AO95239 1232 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 ADH6P28332 368 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 GPLD1P80108 840 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 GAS6Q14393 721 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 SALL4Q9UJQ4 1053 aa9.29□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 C2CD2LO14523 706 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 SORBS3O60504 671 aa9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
RABGGTB-205ENST00000462042 NCAPG2Q86XI2 1143 aa9.28□□□□□ -0.92
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